More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1289 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  73.83 
 
 
428 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  874    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  69.79 
 
 
427 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  71.6 
 
 
428 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0554  histidinol dehydrogenase  68.31 
 
 
443 aa  592  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.677431  normal  0.387013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  66.12 
 
 
428 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  63.08 
 
 
430 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
428 aa  425  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  50.75 
 
 
429 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  50.87 
 
 
429 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  50.75 
 
 
429 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  50.87 
 
 
429 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  50.62 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  50.5 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  50.87 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  50.5 
 
 
429 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  50.5 
 
 
429 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  50.62 
 
 
429 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
427 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  53.74 
 
 
443 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  51.39 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  53.15 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  45.22 
 
 
424 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
422 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 
454 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 
432 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  45.92 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  48.6 
 
 
433 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  51.2 
 
 
432 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  46.6 
 
 
446 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  48.01 
 
 
436 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  49.63 
 
 
429 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 
436 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
439 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 
435 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 
436 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
439 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  49.37 
 
 
434 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  50.25 
 
 
430 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
430 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  48.15 
 
 
436 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  49.37 
 
 
441 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  48.75 
 
 
449 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 
457 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  46.99 
 
 
434 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  47.67 
 
 
430 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
447 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  48.02 
 
 
440 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  46.57 
 
 
442 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  48.75 
 
 
449 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  48.27 
 
 
440 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  47.77 
 
 
425 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  46.89 
 
 
434 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  48.23 
 
 
428 aa  379  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  47.36 
 
 
433 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  48.12 
 
 
424 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 
428 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  48.32 
 
 
439 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  47.82 
 
 
434 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  46.44 
 
 
448 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  46.29 
 
 
448 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  46.75 
 
 
431 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  49.49 
 
 
429 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  43.84 
 
 
428 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  49.24 
 
 
429 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 
435 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  46.8 
 
 
441 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  49 
 
 
432 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  47.46 
 
 
430 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  46.92 
 
 
428 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  46.04 
 
 
435 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  48.58 
 
 
447 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  47.09 
 
 
429 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  46.14 
 
 
428 aa  375  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  50.25 
 
 
439 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  47.42 
 
 
441 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  46.3 
 
 
436 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  47.26 
 
 
440 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  46.67 
 
 
441 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  43.42 
 
 
433 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  46.96 
 
 
444 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  46.55 
 
 
441 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  48.18 
 
 
425 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  46.65 
 
 
436 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  49.28 
 
 
447 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 
438 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  48.4 
 
 
433 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  46.76 
 
 
440 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  45.06 
 
 
440 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 
441 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  47.93 
 
 
452 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  43.93 
 
 
423 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 
440 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  48.55 
 
 
426 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
445 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
445 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
438 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
438 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>