More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0666 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  875    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  57.86 
 
 
424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  58.59 
 
 
422 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  53.04 
 
 
428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  52.24 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  53.4 
 
 
428 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  53.74 
 
 
428 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  52.53 
 
 
428 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
430 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 
428 aa  431  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 
430 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 
426 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 
429 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  49.39 
 
 
429 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  48.45 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  48.1 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  47.86 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  48.45 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  49.3 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  48.1 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  47.97 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  48.31 
 
 
427 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  47.86 
 
 
429 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  47.86 
 
 
429 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  51.02 
 
 
427 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  54.29 
 
 
435 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 
437 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  44.24 
 
 
424 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  53.62 
 
 
431 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 
434 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  51.81 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  52.74 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
429 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0554  histidinol dehydrogenase  53.3 
 
 
443 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.677431  normal  0.387013 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  47.83 
 
 
430 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  51.43 
 
 
430 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  53.71 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  51.45 
 
 
436 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  51.84 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  50.49 
 
 
433 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  53.45 
 
 
439 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  50.61 
 
 
457 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  52.68 
 
 
436 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  48.06 
 
 
430 aa  393  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  49.51 
 
 
454 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  47.98 
 
 
428 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  52.8 
 
 
426 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  50.62 
 
 
436 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  49.52 
 
 
432 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  48.92 
 
 
429 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  49.63 
 
 
448 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  50.61 
 
 
439 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  48.03 
 
 
429 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 
424 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  49.64 
 
 
432 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 
438 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  50.61 
 
 
439 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
441 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  48.43 
 
 
434 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  49.01 
 
 
448 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  51.57 
 
 
434 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  50.37 
 
 
440 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
427 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 
441 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 
436 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  49.28 
 
 
436 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  49.14 
 
 
433 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  51.35 
 
 
438 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  49.87 
 
 
441 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 
434 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  50.25 
 
 
436 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 
441 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
433 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  47.84 
 
 
433 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  50.62 
 
 
452 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  52.99 
 
 
434 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  50 
 
 
433 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  48.05 
 
 
440 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  48.51 
 
 
441 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
425 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
445 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  48.05 
 
 
440 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  50.98 
 
 
447 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  47.72 
 
 
435 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  49.4 
 
 
435 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  51.34 
 
 
447 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  45.71 
 
 
425 aa  372  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  51.23 
 
 
447 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  46.6 
 
 
430 aa  375  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  48.51 
 
 
440 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  49.17 
 
 
440 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  49.41 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  46.76 
 
 
436 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>