More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2814 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
434 aa  869    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  71.36 
 
 
436 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  69.21 
 
 
434 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1051  histidinol dehydrogenase  64.98 
 
 
434 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  61.75 
 
 
436 aa  541  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  63.43 
 
 
436 aa  541  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  54.59 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  56.28 
 
 
424 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  55.53 
 
 
422 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
426 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
430 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  52.81 
 
 
432 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  48.56 
 
 
432 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  46.79 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
424 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  47.81 
 
 
454 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  46.63 
 
 
437 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  48.04 
 
 
434 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 
434 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 
429 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  47.04 
 
 
429 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  46.35 
 
 
429 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  46.01 
 
 
427 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  46.23 
 
 
429 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 
429 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  46.23 
 
 
429 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
436 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  46.23 
 
 
429 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  45.99 
 
 
429 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  45.99 
 
 
429 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  44.8 
 
 
428 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  46.23 
 
 
429 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  49.13 
 
 
433 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  48.76 
 
 
430 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  48.74 
 
 
435 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  52.99 
 
 
443 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  44.34 
 
 
428 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  47.77 
 
 
436 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  49.41 
 
 
438 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 
434 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  48.71 
 
 
441 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 
441 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
435 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  43.43 
 
 
424 aa  363  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  46.04 
 
 
427 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  48.13 
 
 
441 aa  362  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  49.29 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  46.17 
 
 
429 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  47.83 
 
 
436 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  45.94 
 
 
436 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  48.1 
 
 
433 aa  361  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  46.44 
 
 
432 aa  361  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  46.4 
 
 
429 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  43.78 
 
 
440 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 
441 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  46.26 
 
 
428 aa  360  4e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  47.71 
 
 
429 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  47.44 
 
 
431 aa  359  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
439 aa  358  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 
449 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  47.24 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 
449 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  48.71 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  47.6 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  46.17 
 
 
429 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  48.71 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  48.94 
 
 
436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  47.99 
 
 
435 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  50.69 
 
 
440 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  43.76 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 
448 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  46.78 
 
 
432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  48.34 
 
 
441 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  50.47 
 
 
445 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  47.03 
 
 
428 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 
434 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
445 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  47.53 
 
 
448 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 
433 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 
433 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  45.91 
 
 
427 aa  350  3e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 
442 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  45.61 
 
 
427 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  46.4 
 
 
430 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
440 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  47.28 
 
 
425 aa  348  8e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  44.93 
 
 
431 aa  348  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  46.24 
 
 
433 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  45.75 
 
 
439 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  49.32 
 
 
440 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  46.85 
 
 
457 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  46.03 
 
 
433 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  45.67 
 
 
428 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>