More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1008 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 434 aa  884    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  67.97 
 
 		 436 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  69.21 
 
 		 434 aa  594  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1051  histidinol dehydrogenase  64.81 
 
 		 434 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  61.57 
 
 		 436 aa  548  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  61.66 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  53.28 
 
 		 434 aa  448  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  58.5 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  54.16 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  55.1 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  51.18 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  51.13 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  51.24 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  51.86 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  51.43 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  48.88 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  47.38 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  46.86 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  47.66 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  48.38 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  47.06 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  46.68 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  48.35 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  48.12 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  46.25 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  46.49 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  46.25 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  46.49 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  46.49 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  49.63 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  50.75 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  48.8 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  48.8 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  48 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  45.15 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  48.86 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  48 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  45.02 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  50.6 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  47.78 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  46.81 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  41.81 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  50.49 
 
 		 443 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  46.19 
 
 		 436 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  48.12 
 
 		 449 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  47.89 
 
 		 441 aa  362  9e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  48.12 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  49.76 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  47 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  44.82 
 
 		 428 aa  360  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  47.87 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  50.13 
 
 		 452 aa  359  6e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 		 432 aa  358  8e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  44.88 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  46.67 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  47.09 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  44.58 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  44.5 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 		 428 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 427 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  47.92 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  47.79 
 
 		 441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  49.52 
 
 		 434 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  48.51 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  46 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  45.87 
 
 		 427 aa  350  4e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  47.37 
 
 		 425 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  47.19 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  47.51 
 
 		 438 aa  348  9e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  47.23 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  47.3 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  47.44 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  45.5 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  44.42 
 
 		 430 aa  348  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  46.34 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  48.34 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  43.81 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  48.2 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  44.37 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  47.21 
 
 		 432 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  46.8 
 
 		 430 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  47.93 
 
 		 438 aa  345  8e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  47.87 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  46.54 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  47.03 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  47.3 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  46.84 
 
 		 434 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  47.04 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 		 431 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>