More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1709 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  96.03 
 
 
428 aa  834    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  864    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  46.28 
 
 
430 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  46.12 
 
 
422 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  45.63 
 
 
424 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  45.77 
 
 
426 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  45.77 
 
 
432 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  44.66 
 
 
424 aa  363  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  47.73 
 
 
429 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  45.08 
 
 
432 aa  361  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  45.01 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  46.15 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  44.73 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  46.78 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  46.02 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  45.37 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  44.58 
 
 
434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  45.78 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  44.98 
 
 
429 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  43.29 
 
 
452 aa  356  5e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  46.3 
 
 
427 aa  356  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  43.3 
 
 
436 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 
429 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 
429 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 
429 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 
429 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  47.68 
 
 
429 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  44.84 
 
 
424 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  47.29 
 
 
429 aa  352  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  45.06 
 
 
429 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 
434 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  45.41 
 
 
425 aa  349  5e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 
436 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  47.58 
 
 
435 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  45.28 
 
 
429 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1051  histidinol dehydrogenase  42.76 
 
 
434 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  47 
 
 
439 aa  346  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 
430 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  43.95 
 
 
431 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  43.84 
 
 
428 aa  341  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 
427 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  42.68 
 
 
434 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  44.07 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 
432 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  43.34 
 
 
436 aa  339  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  43.78 
 
 
431 aa  338  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  43.5 
 
 
430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  44.29 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  43.24 
 
 
457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  43.57 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  40.85 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  43.9 
 
 
426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  44.89 
 
 
431 aa  335  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  42.11 
 
 
434 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  43.03 
 
 
427 aa  335  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  42.04 
 
 
428 aa  334  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 
430 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  43.1 
 
 
445 aa  332  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  43.1 
 
 
431 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  42.31 
 
 
434 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  42.3 
 
 
428 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  43.78 
 
 
426 aa  332  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  42.14 
 
 
434 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 
438 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 
432 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  42.31 
 
 
434 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 
432 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  41.57 
 
 
427 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  42.46 
 
 
436 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 
431 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  43.17 
 
 
431 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  41.87 
 
 
433 aa  330  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  43.34 
 
 
430 aa  329  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  41 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  41.29 
 
 
431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  43.34 
 
 
430 aa  329  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  42.31 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  44.2 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  41.76 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 
434 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 
428 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 
434 aa  325  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  42.68 
 
 
436 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  41.65 
 
 
435 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  39.72 
 
 
432 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  42.36 
 
 
433 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  43.13 
 
 
425 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  41.3 
 
 
437 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  43.13 
 
 
431 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  42.51 
 
 
436 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  41.08 
 
 
441 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  41.43 
 
 
449 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  41.43 
 
 
449 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  42 
 
 
454 aa  323  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  41.97 
 
 
439 aa  322  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  41.31 
 
 
448 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  42.22 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  40.47 
 
 
441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>