More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3222 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
434 aa  877    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  52.47 
 
 
434 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  49.29 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  48.16 
 
 
437 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  51.13 
 
 
434 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
454 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  51.18 
 
 
434 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  49.4 
 
 
427 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  52.22 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  51.63 
 
 
436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  47.88 
 
 
434 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  50.81 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  50.69 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  51.49 
 
 
435 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  48.81 
 
 
429 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 
436 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
432 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  48.26 
 
 
429 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  48.14 
 
 
429 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  48.01 
 
 
429 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 
436 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  47.89 
 
 
429 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  48.1 
 
 
429 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  48.01 
 
 
429 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  49.05 
 
 
429 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  49.16 
 
 
422 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  49.2 
 
 
441 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 
424 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
426 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  48.05 
 
 
436 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  49.63 
 
 
424 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 
434 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  47.26 
 
 
429 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  48.06 
 
 
431 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  47.26 
 
 
429 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 
430 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1051  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 
434 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  47.26 
 
 
429 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  47.01 
 
 
429 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  50.49 
 
 
439 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  48.14 
 
 
425 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  49.52 
 
 
429 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  48.32 
 
 
427 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  47.26 
 
 
429 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  48.23 
 
 
432 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  42.48 
 
 
424 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  45.52 
 
 
427 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  45.22 
 
 
428 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  41.47 
 
 
428 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  47.86 
 
 
457 aa  362  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  47.38 
 
 
431 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  43.09 
 
 
428 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  44.16 
 
 
426 aa  358  9e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  47.28 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  41.42 
 
 
428 aa  356  5e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  44.68 
 
 
428 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  49.01 
 
 
452 aa  352  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1332  histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 
435 aa  350  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  43.67 
 
 
449 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  43.67 
 
 
449 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  46.98 
 
 
427 aa  346  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  43.99 
 
 
437 aa  345  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  40.71 
 
 
440 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  44.02 
 
 
423 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  44.98 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  46.98 
 
 
445 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  41.71 
 
 
430 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  46.65 
 
 
426 aa  342  8e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  42.89 
 
 
442 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  48.88 
 
 
431 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  43.74 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  43.25 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  43.74 
 
 
428 aa  340  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  43.4 
 
 
428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  48.23 
 
 
430 aa  338  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  43.71 
 
 
430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  48.01 
 
 
432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  47.62 
 
 
430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  47.62 
 
 
430 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2170  histidinol dehydrogenase  44.03 
 
 
460 aa  334  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 
446 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  47.49 
 
 
431 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  41.51 
 
 
428 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  46.77 
 
 
432 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  47.51 
 
 
432 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  48.12 
 
 
430 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  47.62 
 
 
431 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  46.77 
 
 
431 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  43.4 
 
 
428 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  46.38 
 
 
436 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  43.26 
 
 
428 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  42.33 
 
 
426 aa  330  3e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  41.86 
 
 
428 aa  330  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  41 
 
 
428 aa  329  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  47.41 
 
 
434 aa  329  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  44.79 
 
 
430 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  46.85 
 
 
434 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  42.69 
 
 
432 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>