More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0309 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
436 aa  884    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  65.74 
 
 
436 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  62.04 
 
 
436 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  61.66 
 
 
434 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  63.43 
 
 
434 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1051  histidinol dehydrogenase  57.87 
 
 
434 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  52.77 
 
 
434 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  54.5 
 
 
424 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  52.53 
 
 
426 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  52.55 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 
429 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  48.62 
 
 
436 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  48.5 
 
 
429 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  48.27 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 
434 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  51.08 
 
 
424 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
434 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 
436 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  48.85 
 
 
430 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  50.74 
 
 
434 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  46.99 
 
 
432 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
434 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 
433 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  48.05 
 
 
441 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  47.58 
 
 
431 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  48.84 
 
 
432 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
432 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  45.15 
 
 
428 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
441 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 
440 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  48.37 
 
 
427 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
441 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  47.48 
 
 
448 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
441 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  47.36 
 
 
432 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
441 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  47.89 
 
 
454 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 
440 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  47.36 
 
 
448 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  48.33 
 
 
433 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  48.8 
 
 
440 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
438 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  46.93 
 
 
429 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  47.17 
 
 
429 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 
436 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  48.04 
 
 
433 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  46.9 
 
 
435 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  45.7 
 
 
429 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  47.39 
 
 
436 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  52.21 
 
 
432 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  48.03 
 
 
436 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  45.57 
 
 
429 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  45.81 
 
 
429 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  45.57 
 
 
429 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  45.7 
 
 
429 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 
446 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  45.57 
 
 
429 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  43.1 
 
 
424 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  48.33 
 
 
435 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  49.63 
 
 
438 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  45.32 
 
 
429 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  48.16 
 
 
431 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  50.37 
 
 
437 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  45.21 
 
 
429 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  47.38 
 
 
435 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  42.99 
 
 
437 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  46.29 
 
 
433 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 
444 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  47.87 
 
 
427 aa  359  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  47.6 
 
 
439 aa  359  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 
431 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  43.06 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  46.42 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  47.79 
 
 
439 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  47.09 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 
439 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  46.36 
 
 
445 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  47.03 
 
 
430 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
447 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  46.49 
 
 
445 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 
438 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  44.33 
 
 
427 aa  354  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  44.63 
 
 
427 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  44.6 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  47.76 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  46.82 
 
 
438 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  47.95 
 
 
447 aa  353  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  46.82 
 
 
438 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  45.3 
 
 
441 aa  353  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  47.58 
 
 
449 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  48.18 
 
 
445 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  48.39 
 
 
447 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  45.1 
 
 
427 aa  352  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  47.58 
 
 
449 aa  352  7e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  48.18 
 
 
445 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  48.18 
 
 
445 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  48.18 
 
 
445 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>