More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2178 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 436 aa  873    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  67.97 
 
 		 434 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  71.36 
 
 		 434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1051  histidinol dehydrogenase  64.81 
 
 		 434 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  62.04 
 
 		 436 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  60.65 
 
 		 436 aa  532  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  59.65 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  54.03 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  56.53 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  52.88 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  51.59 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  53.03 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  51.24 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  51.63 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  51.49 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  53.71 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  46.99 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  51.86 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  51.61 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  51.12 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  48.97 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  47.37 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  49.31 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  50.75 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  50.25 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  48.79 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  48.04 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  48.04 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  46.9 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  51.48 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  46.36 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  46.67 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  52.61 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  47.86 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  50.84 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  51.33 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  48.26 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  50.74 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  52.07 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  48.31 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  45.87 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  50.99 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  52.68 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  49.16 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  47.99 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  47.9 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  45.97 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  45.97 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  45.97 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  43 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  52.57 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  48.46 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  48.66 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  51.23 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  48.38 
 
 		 441 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  48.04 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  50.73 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  48.31 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  50.73 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  50.74 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  51.8 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  49.51 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  48.15 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  48.69 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  48.69 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  43.82 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  49.51 
 
 		 441 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  48.68 
 
 		 448 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  52.32 
 
 		 447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 		 426 aa  362  9e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  48.69 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  50.85 
 
 		 447 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  50.6 
 
 		 447 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  45.39 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  46.43 
 
 		 433 aa  358  7e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  49.76 
 
 		 440 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  47.65 
 
 		 428 aa  358  8e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 		 427 aa  358  8e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  41.26 
 
 		 428 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  51.46 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  48.29 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  49.17 
 
 		 444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  46.25 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>