More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6092 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
436 aa  895    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  77.83 
 
 
437 aa  705    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  57.38 
 
 
435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 
435 aa  501  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  48 
 
 
435 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  47.6 
 
 
430 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  47.18 
 
 
441 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  46.95 
 
 
441 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  47.54 
 
 
428 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  47.54 
 
 
428 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  48.59 
 
 
436 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  47.54 
 
 
428 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  45.33 
 
 
443 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  47.1 
 
 
437 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  48.51 
 
 
429 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 
435 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 
436 aa  363  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  51.12 
 
 
444 aa  362  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  48.52 
 
 
443 aa  361  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  45.61 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  47.28 
 
 
439 aa  348  8e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  45.31 
 
 
441 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 
432 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  38.24 
 
 
428 aa  294  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  38.26 
 
 
422 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 
435 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  37.86 
 
 
446 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  38.22 
 
 
424 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  40.71 
 
 
424 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 
429 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  36.79 
 
 
426 aa  252  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 
431 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 
436 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  36.21 
 
 
429 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  36.39 
 
 
429 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 
436 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  34.45 
 
 
427 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  37.22 
 
 
430 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  38.4 
 
 
431 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  36.98 
 
 
439 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  33.25 
 
 
428 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  33.25 
 
 
428 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  38.86 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  38.16 
 
 
437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  35.4 
 
 
433 aa  243  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  34.48 
 
 
433 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  35.51 
 
 
428 aa  243  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 
426 aa  243  6e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  35.22 
 
 
429 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  35.48 
 
 
429 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  38.67 
 
 
434 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  36.14 
 
 
430 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
434 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  34.42 
 
 
424 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  35.22 
 
 
429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  34.76 
 
 
429 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  36.49 
 
 
432 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 
434 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  37.28 
 
 
431 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  32.54 
 
 
440 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  35.24 
 
 
429 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  34.98 
 
 
429 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
434 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  34.98 
 
 
429 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  34.52 
 
 
429 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  34.98 
 
 
429 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  36.48 
 
 
434 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  35.24 
 
 
429 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  35.57 
 
 
439 aa  236  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  35.5 
 
 
426 aa  236  7e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 
429 aa  236  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  35.58 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  34.84 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  33.91 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 
457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  36.08 
 
 
428 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  35.17 
 
 
427 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  35.83 
 
 
430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  35.68 
 
 
424 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  35.85 
 
 
440 aa  233  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 
436 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  32.35 
 
 
428 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 
445 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  34.42 
 
 
424 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  32.7 
 
 
428 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  35.24 
 
 
428 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  36.67 
 
 
434 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  34.57 
 
 
427 aa  231  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  34.01 
 
 
437 aa  231  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  36.36 
 
 
439 aa  231  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  36.54 
 
 
430 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  34.59 
 
 
426 aa  231  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  34.89 
 
 
434 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  34.49 
 
 
436 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  36.76 
 
 
438 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  33.58 
 
 
430 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  34.77 
 
 
433 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  33.67 
 
 
424 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  33.82 
 
 
448 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>