More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2034 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  79.72 
 
 		 435 aa  722    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  893    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  57.38 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  56.84 
 
 		 437 aa  508  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  47.17 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  46.86 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  46.15 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  46.08 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  46.68 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  45.2 
 
 		 443 aa  362  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  46.97 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  45.7 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  43.95 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  44.99 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  44.99 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  44.99 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  43.91 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  44.73 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  45.39 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  47.26 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  46.23 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  43.27 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  37.35 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  36.8 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  35.53 
 
 		 427 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  38.92 
 
 		 424 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  38.37 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  35.65 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  37 
 
 		 426 aa  256  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.28 
 
 		 426 aa  255  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  37.13 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  36.83 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  36.56 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  34.69 
 
 		 427 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  35.75 
 
 		 428 aa  253  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  34.06 
 
 		 429 aa  253  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  36.34 
 
 		 429 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  34.5 
 
 		 424 aa  252  9.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  35.43 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  36.67 
 
 		 434 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  33.73 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 		 434 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 		 434 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 		 436 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  36.02 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  36.49 
 
 		 434 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  37.05 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 457 aa  247  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  35.56 
 
 		 431 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  38.07 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  35.78 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  32.62 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  35.31 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  35.55 
 
 		 434 aa  246  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  35.55 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  35.31 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  35.8 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  36.76 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  37.19 
 
 		 439 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  35.31 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  34.25 
 
 		 426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  35.15 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  32.22 
 
 		 440 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  35.66 
 
 		 413 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  34.03 
 
 		 867 aa  242  7.999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  33.96 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  35.71 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  33.99 
 
 		 430 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  35.82 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  37.31 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  39.46 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  35.89 
 
 		 436 aa  239  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  35.82 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  36.98 
 
 		 432 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 434 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  36.08 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  35.71 
 
 		 434 aa  239  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9654  predicted protein  40.63 
 
 		 347 aa  239  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.971047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 		 434 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  33.33 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  31.74 
 
 		 428 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  34.23 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  35.24 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  35.16 
 
 		 439 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  35.55 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  36.54 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  35.82 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  36.79 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>