More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7422 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  71.29 
 
 		 428 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  68.13 
 
 		 441 aa  635    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 437 aa  898    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  71.29 
 
 		 428 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  71.29 
 
 		 428 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  69.12 
 
 		 436 aa  634  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  67.74 
 
 		 435 aa  627  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  68.13 
 
 		 441 aa  627  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  67.97 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  69.25 
 
 		 443 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  65.6 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  67.13 
 
 		 435 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  69.19 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  66.43 
 
 		 441 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  63.98 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 439 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  54.61 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  52.83 
 
 		 438 aa  460  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  44.98 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  47.1 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  44.73 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  43.95 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  45.67 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  44.29 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  41.88 
 
 		 424 aa  306  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  42.5 
 
 		 445 aa  305  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  42.22 
 
 		 431 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  42.4 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  42.45 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  42.05 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  41.79 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  43.95 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  41.32 
 
 		 434 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  43.22 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  40.79 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  42.39 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  41.32 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  41.77 
 
 		 431 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  41.32 
 
 		 434 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  42.29 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  41.52 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  40.44 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  41.77 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  41.77 
 
 		 431 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  41.77 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  41.4 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  41.8 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 		 437 aa  279  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  41.46 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  41.77 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  40.79 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  37.15 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  39.7 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  38.86 
 
 		 430 aa  273  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  39.48 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  37.23 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  40 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  38.42 
 
 		 422 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  38.35 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  41.13 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 430 aa  266  7e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  38.35 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  38.35 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  36.75 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  39.66 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  40.49 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  38.75 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  36.47 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  38.46 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  38.24 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  38.33 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  38.24 
 
 		 429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 		 439 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  36.54 
 
 		 430 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  37.77 
 
 		 429 aa  259  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  42 
 
 		 436 aa  259  9e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  36.04 
 
 		 429 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  36.89 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  36.04 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  37.96 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  36.04 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  35.8 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  35.8 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 426 aa  254  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  36.08 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  36.48 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>