More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1713 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 432 aa  884    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  47.13 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  48.87 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  48.65 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  50.37 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  45.93 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  47.62 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  45.54 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  48.88 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  44.42 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  45.54 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  45.93 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  43.54 
 
 		 428 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  44.02 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  43.27 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  43.66 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  40.4 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  42.26 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  38.57 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  40.66 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  39.57 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  41.29 
 
 		 436 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  38.1 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  39.08 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  39.67 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  39.67 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  41.91 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  40.34 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  40.54 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  40.94 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  40.14 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  40.14 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  40.39 
 
 		 426 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  39.52 
 
 		 434 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  39.49 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  39.12 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  39.46 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  41.37 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  39.4 
 
 		 449 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  39.4 
 
 		 449 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  40.15 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  39.52 
 
 		 434 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 429 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  41.9 
 
 		 439 aa  279  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  41.19 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  39.51 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  39.51 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  40 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  42.16 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  38.85 
 
 		 431 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  38.12 
 
 		 429 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  38.17 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  38.14 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  40 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  38.14 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0934  Histidinol dehydrogenase  41.67 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  39.36 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  38.14 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  38.56 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  38.14 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  39.34 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  37.9 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  37.9 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  41.01 
 
 		 447 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  37.86 
 
 		 431 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  39.62 
 
 		 432 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  37.9 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  39.51 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  37.99 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  40.2 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  37.72 
 
 		 429 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.87 
 
 		 429 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  38.33 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38.46 
 
 		 429 aa  269  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 		 435 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  37.14 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>