More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2545 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
429 aa  877    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  63.93 
 
 
430 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  63.53 
 
 
428 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  63.98 
 
 
437 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  64.24 
 
 
436 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  63.53 
 
 
428 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  63.53 
 
 
428 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  64.15 
 
 
441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  60.94 
 
 
443 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  62.5 
 
 
441 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  62.8 
 
 
436 aa  549  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  62.86 
 
 
435 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  62.5 
 
 
441 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  61.08 
 
 
435 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  61.88 
 
 
443 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  63.02 
 
 
444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  56.97 
 
 
439 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  54.83 
 
 
438 aa  487  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  48.87 
 
 
432 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  48.51 
 
 
436 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  45.61 
 
 
428 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  46.19 
 
 
435 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 
435 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  47.28 
 
 
437 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 
431 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  42.79 
 
 
431 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  43.26 
 
 
424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  42.54 
 
 
430 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  42.68 
 
 
434 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  42.31 
 
 
436 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  41.81 
 
 
431 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  42.58 
 
 
430 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  41.47 
 
 
424 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  43.92 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  41.19 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  42.79 
 
 
444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  40.2 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  40.2 
 
 
432 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  40.33 
 
 
422 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  40.79 
 
 
434 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  43.46 
 
 
431 aa  299  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  40.43 
 
 
431 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  41.83 
 
 
431 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  40.9 
 
 
441 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 
432 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  40.29 
 
 
434 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  39.61 
 
 
430 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  40.29 
 
 
434 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  41.05 
 
 
447 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  40.81 
 
 
426 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  41.22 
 
 
433 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  43.21 
 
 
431 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 
438 aa  292  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  41.83 
 
 
431 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  41.22 
 
 
446 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  42.67 
 
 
429 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  38.84 
 
 
430 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  44.2 
 
 
431 aa  289  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  42.24 
 
 
435 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  41.55 
 
 
431 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 
430 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  39.21 
 
 
426 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  40 
 
 
434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38 
 
 
429 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  41.79 
 
 
446 aa  282  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  34.31 
 
 
428 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  37.59 
 
 
429 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  39.6 
 
 
426 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  38.72 
 
 
442 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  38.16 
 
 
425 aa  280  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 
429 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.84 
 
 
429 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  36.21 
 
 
433 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  41.08 
 
 
436 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  39.09 
 
 
454 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  38.9 
 
 
433 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  37.04 
 
 
429 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  38.78 
 
 
433 aa  277  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  38.78 
 
 
433 aa  277  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  34.06 
 
 
428 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  37.04 
 
 
429 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  37.04 
 
 
429 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  39.08 
 
 
434 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  37.84 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  36.96 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  36.83 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  37.09 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  39.55 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  36.79 
 
 
429 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  36.79 
 
 
429 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  39.6 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  38.52 
 
 
437 aa  272  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4273  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 
438 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  38.01 
 
 
440 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  34.55 
 
 
428 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  42.68 
 
 
436 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 
437 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>