More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1091 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  893    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  72.08 
 
 		 436 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  68.52 
 
 		 441 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  71.39 
 
 		 443 aa  614  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  67.13 
 
 		 437 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  67.61 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  67.61 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  67.61 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  65.49 
 
 		 443 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  66.11 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  66.42 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  64.71 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  64.97 
 
 		 441 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  63.82 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  61.08 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  58.68 
 
 		 444 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  55.69 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  50.73 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  46.88 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  43.91 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  44.19 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  43.41 
 
 		 428 aa  349  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  42.93 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  43.28 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  42.43 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  39.57 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  41.15 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  41.71 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  44.06 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  41.46 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  42.2 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  41.19 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  39.27 
 
 		 426 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  40.77 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  40.64 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 430 aa  279  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  40.3 
 
 		 430 aa  279  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  41.83 
 
 		 447 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  40.35 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 		 431 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  42.61 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 		 432 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  38.18 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  38.24 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 		 430 aa  273  6e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  39.6 
 
 		 432 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  37.32 
 
 		 433 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  37.32 
 
 		 433 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  40.25 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38.56 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  41.34 
 
 		 431 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  41.09 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  36.67 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 		 422 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  40.69 
 
 		 429 aa  269  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  38.85 
 
 		 424 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  37.75 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  39.52 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  36.74 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  38.41 
 
 		 431 aa  266  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  37.83 
 
 		 438 aa  266  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  41.55 
 
 		 437 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  42.16 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  40.49 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  35.94 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  37.68 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  36.43 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  36.43 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  37.93 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  36.96 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  36.6 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  40.3 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  36.43 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  36.3 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  36.86 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  41.38 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  35.41 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  36.1 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  36.19 
 
 		 429 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  37.19 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  36.19 
 
 		 429 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  33.17 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>