More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3507 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
433 aa  879    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  67.22 
 
 
426 aa  599  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  55.42 
 
 
426 aa  502  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  54.43 
 
 
416 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  53.56 
 
 
442 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  51.6 
 
 
426 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
416 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
424 aa  413  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  51.48 
 
 
403 aa  413  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
424 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  48.7 
 
 
433 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  49.13 
 
 
428 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  47.19 
 
 
424 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 
425 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  47.88 
 
 
429 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 
434 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  45.35 
 
 
430 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  47.38 
 
 
429 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0450  histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 
424 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.722983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  47.52 
 
 
422 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  48.08 
 
 
427 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  46.78 
 
 
424 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  46.36 
 
 
429 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  45.63 
 
 
429 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  45.39 
 
 
429 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  45.28 
 
 
429 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  45.28 
 
 
429 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  45.28 
 
 
429 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  46.95 
 
 
435 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  45.28 
 
 
429 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 
427 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  45.01 
 
 
429 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  45.04 
 
 
429 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  46.27 
 
 
437 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  47.49 
 
 
457 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2478  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 
425 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  47.04 
 
 
439 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1869  histidinol dehydrogenase  45.86 
 
 
432 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0023  histidinol dehydrogenase  45.15 
 
 
435 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  44.55 
 
 
436 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  45.63 
 
 
425 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  44.76 
 
 
430 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2450  histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 
424 aa  358  7e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.212044  normal  0.13889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 
430 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  44.11 
 
 
432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  46.32 
 
 
431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  45 
 
 
436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  43.9 
 
 
429 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  48.21 
 
 
432 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  43.3 
 
 
446 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
449 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  43.68 
 
 
429 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  43.33 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  44.87 
 
 
449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  42.79 
 
 
429 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  45.04 
 
 
428 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  44.13 
 
 
427 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  45.27 
 
 
427 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  43.91 
 
 
434 aa  350  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  43.99 
 
 
428 aa  350  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  44.66 
 
 
436 aa  349  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  42.09 
 
 
430 aa  348  7e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  45.91 
 
 
431 aa  348  7e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 
436 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  44.1 
 
 
442 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  42.41 
 
 
429 aa  347  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  42.99 
 
 
443 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  43.66 
 
 
428 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  42.99 
 
 
443 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  42.99 
 
 
443 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  45.07 
 
 
429 aa  347  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  44.75 
 
 
425 aa  346  5e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  42.45 
 
 
427 aa  346  6e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  44.11 
 
 
429 aa  345  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  43.26 
 
 
436 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_748  histidinol dehydrogenase  45.73 
 
 
436 aa  345  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.076765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  44.28 
 
 
424 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0844  histidinol dehydrogenase  45.84 
 
 
436 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  46.37 
 
 
431 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  44.28 
 
 
431 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  43.4 
 
 
435 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  43.74 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  44.63 
 
 
429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  43.85 
 
 
434 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  45.79 
 
 
432 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  44.28 
 
 
431 aa  342  5.999999999999999e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  45.91 
 
 
431 aa  342  8e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  41.45 
 
 
428 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  43.52 
 
 
434 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  45.18 
 
 
445 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  42.65 
 
 
454 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  43.16 
 
 
432 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  44.2 
 
 
423 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  43.52 
 
 
434 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  42.59 
 
 
431 aa  340  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  43.52 
 
 
434 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  43.98 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  45.79 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>