More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0763 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0844  histidinol dehydrogenase  86.7 
 
 
436 aa  786    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_748  histidinol dehydrogenase  88.28 
 
 
436 aa  793    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.076765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
436 aa  885    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  48.63 
 
 
437 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 
433 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  50.13 
 
 
439 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 
427 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2013  histidinol dehydrogenase  47.52 
 
 
444 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 
431 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  47.87 
 
 
429 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  47.52 
 
 
428 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  46 
 
 
424 aa  362  6e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  47.87 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 
429 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 
429 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  46.02 
 
 
426 aa  361  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  44.67 
 
 
454 aa  362  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  46.87 
 
 
429 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  46.62 
 
 
429 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  48.23 
 
 
430 aa  359  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 
425 aa  358  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 
429 aa  358  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  45.77 
 
 
427 aa  358  8e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  44.32 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  47.88 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  47.22 
 
 
427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  45.97 
 
 
428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  47.36 
 
 
430 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  47.91 
 
 
429 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  45.08 
 
 
433 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  48.51 
 
 
431 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  47.91 
 
 
436 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  47.84 
 
 
440 aa  353  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  46.68 
 
 
436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  48.08 
 
 
432 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 
434 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  47.29 
 
 
429 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  48 
 
 
435 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  47.42 
 
 
429 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  42.24 
 
 
446 aa  350  4e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  46.13 
 
 
427 aa  349  5e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  47.38 
 
 
435 aa  349  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  46.9 
 
 
435 aa  348  9e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  46.4 
 
 
432 aa  348  9e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 
433 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  49.63 
 
 
432 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  43.08 
 
 
435 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  46.14 
 
 
425 aa  348  1e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  45.52 
 
 
429 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  45.43 
 
 
441 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
424 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  44.92 
 
 
428 aa  347  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 
422 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  47.38 
 
 
433 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  45.56 
 
 
428 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  45.61 
 
 
433 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  45.5 
 
 
434 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  47.32 
 
 
428 aa  346  6e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  46.38 
 
 
432 aa  345  8.999999999999999e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  46.12 
 
 
433 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  44.63 
 
 
430 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  45.56 
 
 
439 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  44.1 
 
 
427 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  47.61 
 
 
424 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  44.34 
 
 
428 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  45.18 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  45.33 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  45.35 
 
 
426 aa  342  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  45.39 
 
 
449 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  45.39 
 
 
449 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  46.81 
 
 
444 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  46.58 
 
 
440 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  45.32 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  46.58 
 
 
440 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  47.03 
 
 
440 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  45.69 
 
 
423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 
438 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0753  histidinol dehydrogenase  44.89 
 
 
473 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0584  histidinol dehydrogenase  45.14 
 
 
497 aa  338  8e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.140343  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4273  histidinol dehydrogenase  48.02 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  43.43 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  45.57 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  44.3 
 
 
428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 
438 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  44.55 
 
 
437 aa  336  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  46.57 
 
 
445 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  46.08 
 
 
448 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0554  histidinol dehydrogenase  46.81 
 
 
443 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.677431  normal  0.387013 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  45.08 
 
 
440 aa  335  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  45.32 
 
 
441 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  45.06 
 
 
441 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 
433 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 
433 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  45.2 
 
 
441 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  45.81 
 
 
457 aa  332  7.000000000000001e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1332  histidinol dehydrogenase  45.24 
 
 
435 aa  332  8e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>