More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0584 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0584  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
497 aa  979    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.140343  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3179  histidinol dehydrogenase  59.85 
 
 
443 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518021  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2906  histidinol dehydrogenase  58.37 
 
 
447 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108283  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2013  histidinol dehydrogenase  53.12 
 
 
444 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0934  Histidinol dehydrogenase  55.7 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0234034  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  47.62 
 
 
434 aa  364  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  51.11 
 
 
425 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0766  histidinol dehydrogenase  54.52 
 
 
415 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15153  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 
430 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  48.53 
 
 
426 aa  359  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  46.52 
 
 
437 aa  356  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  43.58 
 
 
428 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  47.1 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2365  histidinol dehydrogenase  55.1 
 
 
422 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  46.97 
 
 
422 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  45.14 
 
 
436 aa  338  9e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  47.41 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  43.56 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  47.95 
 
 
434 aa  336  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  47.26 
 
 
429 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  46.52 
 
 
429 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  45.98 
 
 
435 aa  333  6e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  47.27 
 
 
429 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  45.77 
 
 
434 aa  332  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  43.81 
 
 
429 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  44.33 
 
 
429 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  44.6 
 
 
425 aa  331  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  48.66 
 
 
424 aa  330  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  46.8 
 
 
432 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  42.57 
 
 
427 aa  329  6e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  46.27 
 
 
429 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  43.84 
 
 
429 aa  329  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  43.32 
 
 
429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0844  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 
436 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  45.25 
 
 
428 aa  326  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_748  histidinol dehydrogenase  44.39 
 
 
436 aa  326  7e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.076765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  43.56 
 
 
429 aa  326  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  43.32 
 
 
429 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 
429 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  42.32 
 
 
429 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 
429 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
446 aa  325  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  48.64 
 
 
430 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  43.35 
 
 
429 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  43.32 
 
 
433 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  43.11 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  44.42 
 
 
439 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  42.36 
 
 
428 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  46.78 
 
 
432 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  46.04 
 
 
436 aa  317  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  47.13 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  43.58 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  42.06 
 
 
440 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  44.42 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  42.18 
 
 
427 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  42.11 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  43.89 
 
 
436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  43.11 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  45.19 
 
 
434 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  41.77 
 
 
423 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  42.57 
 
 
427 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  46.06 
 
 
438 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  44.44 
 
 
433 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  44.55 
 
 
441 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  46.19 
 
 
457 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 
433 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  44.78 
 
 
436 aa  310  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  46.68 
 
 
438 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  42.71 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  41.75 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  44.42 
 
 
445 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  43.98 
 
 
432 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  44 
 
 
436 aa  306  7e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  37.28 
 
 
428 aa  306  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 
430 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  40.28 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  43.89 
 
 
448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  41.85 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  45.64 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1051  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  45.07 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  37.69 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  43.75 
 
 
441 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  43.42 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  45.66 
 
 
436 aa  302  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 
431 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  42.46 
 
 
442 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  43.25 
 
 
441 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  45.93 
 
 
434 aa  302  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  43.64 
 
 
448 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4273  histidinol dehydrogenase  47.28 
 
 
438 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  39.5 
 
 
429 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  43.67 
 
 
440 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  45.52 
 
 
442 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  43.67 
 
 
440 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>