More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_748 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0844  histidinol dehydrogenase  95.17 
 
 		 436 aa  841    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  88.28 
 
 		 436 aa  793    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_748  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 436 aa  884    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.076765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  48.88 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  48 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  48.85 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  45.27 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  47.37 
 
 		 429 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  47.37 
 
 		 429 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  46.76 
 
 		 432 aa  359  6e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2013  histidinol dehydrogenase  46.9 
 
 		 444 aa  358  7e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  45.25 
 
 		 424 aa  358  7e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  46.32 
 
 		 426 aa  358  9e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  47.58 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  45.31 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  45.08 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  47.36 
 
 		 440 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  46.9 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  47.84 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  47.58 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  45.68 
 
 		 454 aa  353  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  48.61 
 
 		 440 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  47.65 
 
 		 429 aa  352  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 		 434 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  46.48 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  47.01 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  48.38 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  47.76 
 
 		 433 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  43.64 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  45.73 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  47.41 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  46.25 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  47.5 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  47 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  48.1 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  47.41 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  43.54 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  47.18 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  48 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  48.35 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  45.73 
 
 		 433 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  47.59 
 
 		 441 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  47.9 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  45.26 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  48.35 
 
 		 448 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  48.1 
 
 		 448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 		 440 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  46.37 
 
 		 436 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  47.1 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  47.09 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  45.66 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  49 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  46.15 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  46.68 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  45.43 
 
 		 439 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  43.69 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  45.25 
 
 		 441 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  47.09 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  42.63 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4273  histidinol dehydrogenase  47.77 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  45.84 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  46.55 
 
 		 425 aa  340  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  45.36 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  47.57 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  44.36 
 
 		 428 aa  339  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  46.5 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  41.32 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  43.91 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  44.05 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  47.15 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  48.63 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0753  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  46.55 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  46.55 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  44.95 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  47.19 
 
 		 422 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  46.53 
 
 		 439 aa  332  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  47.16 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  44.67 
 
 		 423 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  46 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  43.9 
 
 		 430 aa  332  9e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>