More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0766 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0766  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
415 aa  826    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15153  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2365  histidinol dehydrogenase  76.03 
 
 
422 aa  569  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0584  histidinol dehydrogenase  54.52 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.140343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2013  histidinol dehydrogenase  52.67 
 
 
444 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0934  Histidinol dehydrogenase  52.26 
 
 
435 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0234034  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 
424 aa  361  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  44.9 
 
 
428 aa  358  9e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  47 
 
 
430 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  43.2 
 
 
434 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2906  histidinol dehydrogenase  53.89 
 
 
447 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108283  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3179  histidinol dehydrogenase  52.07 
 
 
443 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518021  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  50.88 
 
 
424 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  45.04 
 
 
429 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 
429 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  44.53 
 
 
429 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  44.53 
 
 
429 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  44.27 
 
 
429 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  44.78 
 
 
429 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  44.53 
 
 
429 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  44.27 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  47.1 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  45.95 
 
 
432 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  44.53 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  46.35 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  45.86 
 
 
441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 
434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 
426 aa  336  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  42.76 
 
 
429 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  45.23 
 
 
430 aa  335  7e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  43.03 
 
 
427 aa  333  4e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
448 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  45.66 
 
 
432 aa  332  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 
433 aa  332  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  45.82 
 
 
440 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  44.44 
 
 
440 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  45 
 
 
436 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  45.34 
 
 
441 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  46.12 
 
 
436 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  45.34 
 
 
441 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  45.34 
 
 
448 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 
426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  45.84 
 
 
440 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 
438 aa  328  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  45.34 
 
 
441 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  45.86 
 
 
433 aa  328  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  45.21 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  43.55 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  45.86 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  48.77 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  45.68 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  44.16 
 
 
425 aa  325  8.000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  44.1 
 
 
446 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  45.73 
 
 
441 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  45.23 
 
 
431 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  44.25 
 
 
436 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  43.91 
 
 
427 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  45.34 
 
 
435 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  45.77 
 
 
434 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  45.25 
 
 
429 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  44.5 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  43.7 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  48.5 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  42.5 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  43.11 
 
 
433 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  47.97 
 
 
439 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  42.04 
 
 
428 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  45.78 
 
 
433 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  45.78 
 
 
433 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 
436 aa  316  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
435 aa  316  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4273  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 
438 aa  315  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  43.3 
 
 
422 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  44.04 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  42.01 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  43.84 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  39.56 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  40.71 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  43.58 
 
 
435 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_748  histidinol dehydrogenase  43.46 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.076765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  46.5 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  44.36 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  43.98 
 
 
424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  40.47 
 
 
449 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  42.78 
 
 
427 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  44.25 
 
 
436 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  43.21 
 
 
440 aa  312  6.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  45.41 
 
 
432 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  45.93 
 
 
434 aa  312  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_002936  DET0844  histidinol dehydrogenase  42.26 
 
 
436 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  45.41 
 
 
433 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  42.13 
 
 
428 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
438 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  41.01 
 
 
428 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  45.61 
 
 
431 aa  310  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  40.2 
 
 
428 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  44.13 
 
 
457 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  44.7 
 
 
431 aa  305  7e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  42.17 
 
 
428 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>