More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3179 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2906  histidinol dehydrogenase  86.88 
 
 		 447 aa  723    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3179  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 443 aa  871    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2013  histidinol dehydrogenase  63.6 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0934  Histidinol dehydrogenase  64.86 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0584  histidinol dehydrogenase  60.66 
 
 		 497 aa  478  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  49.64 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  48.61 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  44.11 
 
 		 428 aa  368  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  43.72 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  45 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  48.88 
 
 		 434 aa  362  8e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  45.84 
 
 		 434 aa  362  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  48.61 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  46 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 		 454 aa  358  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  49.52 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  45.04 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  44.55 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  48.13 
 
 		 429 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  48.13 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  44.63 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  45.52 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  44.03 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  44.9 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  44.9 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  47.62 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  44.9 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  47.15 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  44.03 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  47.63 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  44.66 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  46.22 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  47.01 
 
 		 429 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  44.37 
 
 		 434 aa  346  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  44.58 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  48.89 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  49.25 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  48.36 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  45.75 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  45.89 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  42.09 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_748  histidinol dehydrogenase  45.34 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.076765  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  48.61 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  47.1 
 
 		 433 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  48.47 
 
 		 457 aa  339  5e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  46.82 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  43.83 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  46.65 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0844  histidinol dehydrogenase  44.2 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  45.84 
 
 		 448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  45.64 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  45.77 
 
 		 441 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  45.02 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  45.91 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  48.29 
 
 		 442 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  45.32 
 
 		 441 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0766  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 		 435 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  47.76 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  43.98 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  45.32 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  44.3 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  46.02 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  45.77 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  47.37 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 		 448 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  44.87 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  48.05 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  45.07 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2365  histidinol dehydrogenase  51.55 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  46.4 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  45.57 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  45.07 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  45.41 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  48.76 
 
 		 447 aa  329  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  44.11 
 
 		 427 aa  329  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  45.41 
 
 		 439 aa  328  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  40.95 
 
 		 427 aa  329  8e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  46.29 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  43.83 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  43.83 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  42.73 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  44.52 
 
 		 440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  44.56 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  41.6 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  44.42 
 
 		 441 aa  325  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  44.64 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  43.5 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  44.19 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  39.65 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  44.13 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  44.29 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  48.26 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  43.25 
 
 		 430 aa  322  6e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  46.5 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>