More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2429 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  77.26 
 
 
413 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  75.81 
 
 
434 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  76.05 
 
 
434 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  81.63 
 
 
442 aa  714    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  76.98 
 
 
434 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  76.51 
 
 
434 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  77.21 
 
 
434 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  81.86 
 
 
442 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  77.44 
 
 
434 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  901    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  901    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  76.98 
 
 
434 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  76.05 
 
 
434 aa  683    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  76.28 
 
 
434 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  75.12 
 
 
434 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  74.01 
 
 
434 aa  670    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  76.05 
 
 
434 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  77.44 
 
 
434 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  75.81 
 
 
434 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  79.25 
 
 
436 aa  707    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  81.12 
 
 
436 aa  699    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  77.03 
 
 
435 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  901    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  66.35 
 
 
430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  65.57 
 
 
436 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  66.12 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  64.02 
 
 
437 aa  574  1.0000000000000001e-163  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  64.71 
 
 
431 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  61.03 
 
 
435 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  56.81 
 
 
433 aa  495  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  57.51 
 
 
433 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  57.38 
 
 
429 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  57.74 
 
 
433 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  56.32 
 
 
439 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 
438 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  57.08 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  56.75 
 
 
438 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  56.81 
 
 
433 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 
434 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  56.58 
 
 
433 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 
443 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  56.58 
 
 
433 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  56.58 
 
 
433 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  56.58 
 
 
433 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  56.78 
 
 
438 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 
435 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  54.8 
 
 
442 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  53.49 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  54.93 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  55.32 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  55.08 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  54.33 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
431 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  52.53 
 
 
429 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  52.15 
 
 
428 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 
426 aa  423  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  47.38 
 
 
429 aa  422  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 
422 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  49.76 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  52.11 
 
 
431 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
439 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  52.57 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 
431 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  47.18 
 
 
867 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  44.99 
 
 
429 aa  383  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  47.66 
 
 
852 aa  381  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  45.73 
 
 
431 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  45.01 
 
 
431 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  45.37 
 
 
867 aa  353  2.9999999999999997e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 
424 aa  348  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  42.99 
 
 
433 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 
433 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  41.59 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  43.97 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  42.33 
 
 
427 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  44 
 
 
426 aa  329  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  40.71 
 
 
426 aa  329  7e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  40.82 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  43.03 
 
 
429 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 
416 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  41.21 
 
 
442 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  42.18 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  42.79 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  43.4 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 
436 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  41.13 
 
 
429 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  42.39 
 
 
425 aa  317  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  42.42 
 
 
403 aa  315  7e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  39.43 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  41.04 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  38.86 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  41.26 
 
 
427 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  40.76 
 
 
429 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  40.52 
 
 
429 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  40.39 
 
 
429 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  40.28 
 
 
429 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 
424 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  41.57 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>