More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4290 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  897    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  81.67 
 
 		 441 aa  739    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  78.65 
 
 		 441 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  75.86 
 
 		 436 aa  710    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  67.74 
 
 		 437 aa  627  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  69.41 
 
 		 443 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  68.14 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  66.67 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  64.71 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  64.71 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  64.71 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  68.09 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  64.71 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  63.89 
 
 		 441 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  62.86 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  55.89 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  57.35 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  50.59 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  48 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  46.6 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  46.15 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  46.42 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  40.61 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  38.93 
 
 		 430 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  40.77 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  39.66 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  39.3 
 
 		 424 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  39.27 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  40 
 
 		 422 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  39.13 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  41.18 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  40.53 
 
 		 431 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  40.53 
 
 		 431 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  40.15 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  38.33 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  39.31 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  38.41 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  38.15 
 
 		 426 aa  264  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  39.02 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  38.41 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  37.9 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  38.67 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  37.96 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  38.76 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  36.75 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  34.07 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  38.26 
 
 		 447 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 		 433 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  42 
 
 		 436 aa  256  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  36.97 
 
 		 430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  38.16 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  37.88 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  34.31 
 
 		 440 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  36.83 
 
 		 446 aa  253  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  35.92 
 
 		 442 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  38.11 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  37.78 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  33.82 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  36.54 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  37.1 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  36.54 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 		 437 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  37.05 
 
 		 439 aa  249  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  37.63 
 
 		 429 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.88 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  38.57 
 
 		 446 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  35.63 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  36.25 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  39.32 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  36.25 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  37.63 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  36.88 
 
 		 428 aa  247  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  37.77 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  37.63 
 
 		 429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  38.24 
 
 		 442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  37.35 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  38.25 
 
 		 426 aa  246  8e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  37.63 
 
 		 429 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  36.86 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  36.7 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  38.66 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  36.25 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  36.08 
 
 		 440 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  39.8 
 
 		 443 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  34.9 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  37.37 
 
 		 429 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>