More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2242 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  78.65 
 
 		 435 aa  716    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 441 aa  908    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  87.53 
 
 		 441 aa  812    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  74.48 
 
 		 436 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  68.13 
 
 		 437 aa  627  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  69.84 
 
 		 436 aa  624  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  67.69 
 
 		 443 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  67.28 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  68.78 
 
 		 430 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  63.92 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  63.92 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  63.92 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  64.97 
 
 		 435 aa  571  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  64.37 
 
 		 441 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  64.15 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  58.13 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  52.78 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  53.62 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  48.11 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  47.18 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  47.97 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  44.68 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  41.03 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  40.43 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  39.76 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  38.5 
 
 		 431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  39.65 
 
 		 424 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  40.54 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 445 aa  279  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  41.1 
 
 		 426 aa  279  9e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  39.23 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 		 447 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  38.6 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  39.2 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  38.56 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  39.75 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  38.2 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  38.69 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  38.59 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  38.59 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  38.28 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 431 aa  266  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  40.91 
 
 		 429 aa  266  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  38.26 
 
 		 438 aa  266  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  39.66 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  35.85 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  37.72 
 
 		 430 aa  262  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  38.95 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  38.21 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  36.86 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  36.74 
 
 		 432 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  38 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  36.99 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  36.84 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  38.25 
 
 		 431 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.75 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  36.75 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  35.99 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  37.35 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  35.85 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  37.94 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  38.69 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 429 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 		 446 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  36.94 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  36.58 
 
 		 433 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  33.17 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  37.3 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  36.3 
 
 		 436 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  34.91 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  36.21 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  39.25 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  38.92 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  35.77 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  35.77 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  39.65 
 
 		 431 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  39.07 
 
 		 439 aa  247  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  34.79 
 
 		 440 aa  246  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 434 aa  246  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  36.59 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>