More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2498 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 439 aa  884    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  63.49 
 
 		 438 aa  580  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  67.4 
 
 		 444 aa  538  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  56.05 
 
 		 436 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  55.9 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  54.52 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  56.97 
 
 		 429 aa  478  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  54.61 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  54.61 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  54.42 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  54.61 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  55.89 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  54.03 
 
 		 443 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  54.17 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  52.78 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  52.55 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  55.69 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  46.92 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  47.28 
 
 		 436 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  45.39 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  43.11 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  43.43 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  43.28 
 
 		 436 aa  293  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  43.8 
 
 		 424 aa  292  8e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  38.98 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  41.54 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  39.7 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  41.54 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  39.42 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  41.46 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  39.44 
 
 		 435 aa  270  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  39.04 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  35.98 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  39.31 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  38.33 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  42.17 
 
 		 434 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  39.55 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  41.38 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  42.39 
 
 		 434 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  42.17 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  41.96 
 
 		 434 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 431 aa  262  8e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  41.67 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  38.12 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  41.06 
 
 		 430 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  41.12 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  40.69 
 
 		 436 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  36.85 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  38.5 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  39.49 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  39.7 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  38.68 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  35.32 
 
 		 429 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  41.41 
 
 		 434 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  39.55 
 
 		 429 aa  256  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  41.67 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  31.55 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  39.28 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 		 439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  34.99 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  38.68 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  38.42 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  37.9 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  36.54 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  38.68 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  37.16 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  38.42 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  40.55 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  39.41 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  38.8 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  39.65 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  39.75 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  40.15 
 
 		 431 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  36.67 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  37.23 
 
 		 416 aa  252  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  35.57 
 
 		 429 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  39.8 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  41.32 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  39.14 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  41.19 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  35.07 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  34.44 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  38.66 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  35.75 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>