More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4267 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 436 aa  882    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  72.18 
 
 		 441 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  72.71 
 
 		 443 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  70.07 
 
 		 441 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  69.84 
 
 		 441 aa  624  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  69.34 
 
 		 443 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  67.97 
 
 		 437 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  72.08 
 
 		 435 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  69.21 
 
 		 436 aa  624  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  70.42 
 
 		 428 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  70.42 
 
 		 428 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  70.42 
 
 		 428 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  68.14 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  69.34 
 
 		 430 aa  594  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  64.24 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  56.05 
 
 		 439 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  60.34 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  55.09 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  47.13 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  48.59 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  47.88 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  43.94 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  46.97 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  47.32 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  44.1 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  41.4 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  44.09 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  43.26 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  42.4 
 
 		 436 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  42.26 
 
 		 431 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  38.92 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  41.04 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  41.34 
 
 		 430 aa  282  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  41.27 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  41.5 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  42.01 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  42.61 
 
 		 447 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  41.37 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  41.37 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  37 
 
 		 429 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  39.8 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  38.08 
 
 		 427 aa  274  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  37.72 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.66 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 422 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  38.13 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  40.76 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  41.45 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  42.34 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  36.5 
 
 		 429 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  39.57 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  39.71 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  38.83 
 
 		 440 aa  269  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  38.56 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  41.09 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  36.75 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  41.09 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  42.57 
 
 		 446 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  39.14 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  39.14 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  40.72 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  40.84 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  40.53 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  37 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  37 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  36.76 
 
 		 430 aa  263  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  41.37 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  42.16 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  36.79 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  38.35 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  35.16 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  38.14 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  37.93 
 
 		 429 aa  259  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  36.68 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  38.24 
 
 		 439 aa  259  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  37.86 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  39.01 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 		 446 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  40.96 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  37.1 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  35.04 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  40.74 
 
 		 431 aa  256  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  40.49 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 434 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  33.66 
 
 		 427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  35.64 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  38.54 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  37.14 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  36.39 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  36.14 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  35.64 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>