More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0769 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  77.83 
 
 
436 aa  705    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
437 aa  885    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  56.84 
 
 
435 aa  508  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  56.12 
 
 
435 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  46.95 
 
 
428 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  46.95 
 
 
428 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  46.95 
 
 
428 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
435 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  47.28 
 
 
429 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  45.52 
 
 
441 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 
430 aa  358  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  44.24 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  46.88 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  47.32 
 
 
436 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  44.68 
 
 
441 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  45.67 
 
 
437 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  46.6 
 
 
436 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  51 
 
 
444 aa  349  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0166395 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  44.55 
 
 
438 aa  340  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  45.07 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 
439 aa  331  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  42.92 
 
 
441 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  39.57 
 
 
432 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  38 
 
 
428 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.78 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  39.71 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  37.15 
 
 
433 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  39.24 
 
 
434 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 
422 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 
446 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  36.63 
 
 
433 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  39.24 
 
 
434 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 
435 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  38.77 
 
 
434 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  37.68 
 
 
429 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 
431 aa  247  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 
424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  38.27 
 
 
429 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  37.19 
 
 
429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  38.74 
 
 
438 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  37.19 
 
 
426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  36.05 
 
 
440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  37.8 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  37.66 
 
 
435 aa  234  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  38.21 
 
 
431 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9654  predicted protein  44.67 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.971047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  36.18 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  36.83 
 
 
440 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 
439 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  38.04 
 
 
442 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  32.14 
 
 
440 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  38.61 
 
 
439 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 
429 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 
438 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  38.42 
 
 
434 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  37.29 
 
 
447 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  36.63 
 
 
434 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  36.19 
 
 
430 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  33.73 
 
 
427 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  38.02 
 
 
431 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
434 aa  229  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  35.88 
 
 
430 aa  229  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  34.17 
 
 
424 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  36.26 
 
 
434 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  34.67 
 
 
424 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  31.19 
 
 
428 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  38.27 
 
 
433 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  36.75 
 
 
446 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  36.75 
 
 
436 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  34.04 
 
 
428 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 
432 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  37.95 
 
 
430 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  32.11 
 
 
428 aa  227  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 
430 aa  227  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  36.19 
 
 
439 aa  227  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  36.76 
 
 
439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  36.14 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  35.04 
 
 
427 aa  226  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  35.92 
 
 
437 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 
430 aa  226  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  36.21 
 
 
457 aa  226  9e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  33.08 
 
 
424 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  35.78 
 
 
440 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  34.99 
 
 
432 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  33.82 
 
 
426 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  35.71 
 
 
436 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  31.43 
 
 
428 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  32.04 
 
 
428 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  37.28 
 
 
431 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  33.42 
 
 
428 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  33.41 
 
 
427 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  35.35 
 
 
441 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  33.02 
 
 
428 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  33.17 
 
 
430 aa  224  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  35.9 
 
 
435 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  35.47 
 
 
441 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  36.48 
 
 
434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>