More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02554 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  891    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  73.54 
 
 		 443 aa  643    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  70.96 
 
 		 443 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  70.16 
 
 		 428 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  70.16 
 
 		 428 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  70.16 
 
 		 428 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  69.19 
 
 		 437 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  70.42 
 
 		 441 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  68.25 
 
 		 436 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  69.34 
 
 		 436 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  68.78 
 
 		 441 aa  605  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  68.09 
 
 		 435 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  66.42 
 
 		 435 aa  591  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 441 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  63.93 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  58.99 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  55.9 
 
 		 439 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  56.52 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  48.65 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 		 435 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  43.23 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  41.4 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  42.18 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  40.8 
 
 		 424 aa  309  8e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  40.88 
 
 		 430 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  40.19 
 
 		 436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  39.81 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  40.29 
 
 		 434 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  39.32 
 
 		 438 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  39.61 
 
 		 431 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  40.39 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  39.09 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  39.09 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  41.78 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  39.56 
 
 		 431 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  38.56 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  39.13 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  38.73 
 
 		 445 aa  282  9e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  39.34 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  39.34 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  39.23 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  39.71 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  38.16 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 		 432 aa  280  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  37.23 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  38.61 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  38.46 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  37.9 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  39.27 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  40.29 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  39.18 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  38.5 
 
 		 442 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 		 430 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 		 422 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  37.81 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  36.86 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 		 431 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 440 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  37.81 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  38.37 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  38.26 
 
 		 444 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  37.01 
 
 		 434 aa  272  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  37.07 
 
 		 433 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  38.22 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  34.87 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  37.07 
 
 		 433 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  37.75 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  37.04 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38.14 
 
 		 429 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  35.77 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  34.38 
 
 		 428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  37.68 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  36.59 
 
 		 430 aa  269  7e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  36.89 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  34.14 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  37.77 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  38.27 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  36.17 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  39.38 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  39.4 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  38.23 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  36.86 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  35.21 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.1 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>