More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3423 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 443 aa  909    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  73.54 
 
 		 430 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  72.71 
 
 		 436 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  70.6 
 
 		 443 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  69.25 
 
 		 437 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  71.39 
 
 		 435 aa  633  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  67.96 
 
 		 441 aa  618  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  67.28 
 
 		 436 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  67.28 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  66.67 
 
 		 435 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  69.76 
 
 		 441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  65.48 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  65.48 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  65.48 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  61.88 
 
 		 429 aa  531  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  54.17 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  54.55 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  56.1 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  49.14 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  48.88 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  46.23 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  45.07 
 
 		 437 aa  346  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  42.24 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  42.62 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  40.09 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  39.66 
 
 		 431 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  40.14 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  38.76 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  39.71 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 		 431 aa  273  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  39.19 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  38.73 
 
 		 445 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 447 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  38.5 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  38.5 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  39.01 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  38.19 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  39.23 
 
 		 431 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  39.84 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  36.11 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  40.67 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  38.52 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  38.82 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  37.04 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  36.72 
 
 		 424 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  36.57 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  38.01 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  39.08 
 
 		 433 aa  256  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  37.78 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  36.6 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  36.88 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  36.6 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  35.98 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  35.87 
 
 		 427 aa  252  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  32.37 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  37.14 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  38.72 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  36.19 
 
 		 436 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  35.63 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  35.93 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  36.34 
 
 		 425 aa  249  7e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  36.36 
 
 		 454 aa  249  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  37.91 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  32.13 
 
 		 428 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  37.66 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  34.13 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  36.23 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 		 437 aa  247  4e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  37.05 
 
 		 431 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  35.12 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  37.97 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  31.65 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  37.03 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  38.41 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  40 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  37.03 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  36.3 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  35.77 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 		 439 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  36.7 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  34.88 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  34.84 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 		 457 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  33.33 
 
 		 428 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  36.7 
 
 		 434 aa  243  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 433 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  34.83 
 
 		 424 aa  242  9e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 433 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  34.84 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  34.84 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>