More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2881 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  897    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  63.87 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  58.96 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  60.09 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  58.04 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  57.21 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  55.61 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  56.88 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  56.78 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  56.78 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  56.78 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  54.57 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  55.01 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  55.48 
 
 		 434 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  55.01 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  55.01 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  55.01 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  55.24 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  54.55 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  54.73 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  54.31 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  55.9 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  52.75 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  54.29 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  54.5 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  53.72 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  54.06 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  54.29 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  53.81 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  53.58 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  54.06 
 
 		 433 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  52.3 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  53.2 
 
 		 438 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  53.12 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  51.98 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  52.64 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  52.69 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  51.99 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  52.22 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  52.46 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  52.11 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  52.24 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  48.71 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  52.83 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  52.36 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  50.35 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  52.72 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  48.15 
 
 		 867 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  48.41 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  45.6 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  49.29 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  45.37 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  48.36 
 
 		 867 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  46.12 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  47.59 
 
 		 852 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  43.33 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  47.24 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  41.37 
 
 		 426 aa  325  9e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  45.01 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  43.89 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  40.65 
 
 		 424 aa  318  9e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  41.98 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  41.25 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  42.47 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0450  histidinol dehydrogenase  42.66 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.722983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  43.83 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  40.58 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  40.34 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  43.7 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  42.93 
 
 		 425 aa  305  8.000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 		 436 aa  305  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  41.09 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  45.73 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  40.97 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  40.58 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  42.27 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  42.93 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  40.35 
 
 		 429 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  39.71 
 
 		 429 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>