More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1617 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  71.13 
 
 		 443 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  71.33 
 
 		 438 aa  634    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  72.39 
 
 		 433 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  894    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  72.62 
 
 		 433 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  72.62 
 
 		 433 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  73.55 
 
 		 442 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  86.59 
 
 		 429 aa  753    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  72.85 
 
 		 433 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  71.69 
 
 		 433 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  71.69 
 
 		 433 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  71.69 
 
 		 433 aa  624  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  71.46 
 
 		 439 aa  627  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  71.23 
 
 		 433 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  71.69 
 
 		 433 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  65.66 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 		 434 aa  494  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  57.38 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  57.38 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  57.14 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  54.99 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  56.44 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  56.44 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  57.61 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 		 436 aa  478  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  56.31 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  58.96 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  55.48 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  54.42 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  56.57 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  54.31 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  54.67 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  56.81 
 
 		 442 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  55.37 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  55.37 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  54.73 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  55.14 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  51.49 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  49.16 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  50.62 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  50.71 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  50.88 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  46.06 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  47.02 
 
 		 867 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  45.52 
 
 		 852 aa  364  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  46.35 
 
 		 867 aa  359  4e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  43.39 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  46.28 
 
 		 439 aa  352  8.999999999999999e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  45.16 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  44.75 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  45.06 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  46 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  41.81 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  44.42 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  43.72 
 
 		 434 aa  324  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  43.04 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  44 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  45 
 
 		 432 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  43.89 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  43.83 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  40.71 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  43.14 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  39.53 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  43.78 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  43.14 
 
 		 431 aa  312  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  43.81 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  43.07 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  44.7 
 
 		 425 aa  312  1e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  45.3 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  42.44 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  42.4 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  40.83 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  42.68 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  43.03 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  43.92 
 
 		 430 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  43.11 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  43.36 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>