More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1141 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 422 aa  859    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  75.29 
 
 		 429 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  62.74 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  60.33 
 
 		 428 aa  519  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  56.34 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  55.16 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  54.65 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  53.11 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 		 436 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  52.28 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  51.91 
 
 		 852 aa  413  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  50.48 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  49.16 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  51.43 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 434 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  49.76 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  50.72 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  51.55 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  50.73 
 
 		 413 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  51.18 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  50.48 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  49.28 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  50.84 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  51.07 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  50.6 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 433 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  48.79 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  50.6 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  50.84 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  48.8 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  48.92 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  49.52 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  49.05 
 
 		 867 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  49.76 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  51.65 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  51.46 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  48.1 
 
 		 867 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  46.88 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  44.58 
 
 		 424 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  46.33 
 
 		 403 aa  345  8e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  44.82 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  47.48 
 
 		 431 aa  335  7e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  45.36 
 
 		 416 aa  333  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  45.06 
 
 		 416 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  47.1 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  45.26 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  43.44 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  44.25 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  42.5 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  41.35 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  44.53 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  43.25 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  41.25 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  43 
 
 		 427 aa  306  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  41.01 
 
 		 436 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  42.76 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  40.33 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  42.54 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  41.09 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  41.09 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  42.68 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  41.01 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  43.17 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  42.34 
 
 		 425 aa  295  9e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  41.95 
 
 		 424 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  39.57 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  40.38 
 
 		 429 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  39.7 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>