More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
439 aa  858    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  60.32 
 
 
431 aa  481  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  58.64 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 
434 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  52.34 
 
 
434 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  52.34 
 
 
434 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  51.87 
 
 
434 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  51.87 
 
 
434 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  54.76 
 
 
431 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  54.67 
 
 
431 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
434 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  51.64 
 
 
434 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
434 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
434 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  51.17 
 
 
434 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  51.17 
 
 
434 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
434 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  51.17 
 
 
434 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 
430 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  52.8 
 
 
413 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
443 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
443 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
443 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 
431 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  49.08 
 
 
431 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  48.83 
 
 
436 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
434 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
442 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
435 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  49.3 
 
 
442 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  49.29 
 
 
438 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  48.72 
 
 
433 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  46.03 
 
 
434 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
443 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  48.15 
 
 
433 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  48.75 
 
 
438 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  44.06 
 
 
429 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  48.39 
 
 
433 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  47.32 
 
 
439 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 
435 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 
435 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  47.72 
 
 
433 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  47.49 
 
 
433 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  45.22 
 
 
442 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  43.13 
 
 
427 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  47.03 
 
 
433 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  47.49 
 
 
433 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  44.81 
 
 
437 aa  371  1e-101  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  47.26 
 
 
433 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  47.93 
 
 
433 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  45.75 
 
 
428 aa  368  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  47.11 
 
 
429 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  46.28 
 
 
438 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  45.98 
 
 
430 aa  360  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  46.15 
 
 
429 aa  359  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  41.76 
 
 
428 aa  349  6e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  41.76 
 
 
428 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  41.3 
 
 
428 aa  346  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  47.03 
 
 
429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  42.56 
 
 
429 aa  341  2e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  44.5 
 
 
867 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  47.55 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  44.79 
 
 
867 aa  337  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  46.19 
 
 
852 aa  336  5e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  41.4 
 
 
431 aa  332  6e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  42.76 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  44.53 
 
 
422 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  40 
 
 
431 aa  325  7e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  42 
 
 
426 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  40.98 
 
 
434 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  42.57 
 
 
441 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  35.03 
 
 
424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  39.52 
 
 
429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  41.83 
 
 
440 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  44.67 
 
 
434 aa  302  8.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  42.52 
 
 
454 aa  302  8.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  38.14 
 
 
427 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 
429 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  40.73 
 
 
432 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 
439 aa  300  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  40.72 
 
 
448 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 
429 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  42.65 
 
 
436 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 
428 aa  299  8e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  41.89 
 
 
426 aa  299  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  39.05 
 
 
429 aa  298  9e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  41.91 
 
 
441 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  39.05 
 
 
429 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  42.08 
 
 
441 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  38.05 
 
 
429 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  41.04 
 
 
433 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  45.34 
 
 
425 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  42.36 
 
 
432 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  38.85 
 
 
429 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 
429 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  41.13 
 
 
441 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 
429 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>