More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6377 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6377  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6208  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6610  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0715405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0694  ABC transporter related  72.24 
 
 		 245 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  51.26 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  51.23 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  50.4 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.68 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  52.8 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.19 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  49.59 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.67 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  51.85 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 242 aa  251  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  50.83 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  52.59 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  51.85 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  51.02 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  50 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  51.23 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  52.07 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  47.13 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  52.34 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  51.03 
 
 		 244 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  52.12 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  49.18 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.75 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.81 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  48.61 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  50.42 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  48.95 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  51.03 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  51.07 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  50.86 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.65 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 244 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  52.12 
 
 		 260 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  50.83 
 
 		 244 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  50.83 
 
 		 245 aa  244  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  50.41 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  48.96 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  50.83 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  49.79 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  50.83 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  50.83 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  50.21 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 245 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  48.33 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  48.1 
 
 		 245 aa  241  7e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  46.72 
 
 		 242 aa  241  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  49.18 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  49.37 
 
 		 248 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  49.15 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  48.72 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  50.62 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.5 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.75 
 
 		 502 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  50.62 
 
 		 241 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  47.74 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  51.44 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  49.17 
 
 		 241 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  47.74 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.17 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  49.18 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  46.69 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  47.35 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  47.35 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  50.21 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  50.21 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  50.65 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  51.48 
 
 		 336 aa  238  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  50.42 
 
 		 239 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  50.42 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  46.67 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  49.39 
 
 		 249 aa  238  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  47.76 
 
 		 244 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 242 aa  238  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  48.95 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>