108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0718 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0718  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 		 166 aa  322  2e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0883  16S rRNA processing protein RimM  26.47 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000602503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0803  16S rRNA processing protein RimM  28.48 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1630  16S rRNA-processing protein RimM  28.85 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000568977  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0551  16S rRNA-processing protein RimM  28.85 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.44188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  28.85 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  25.95 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0365  16S rRNA processing protein RimM  26.58 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000438185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  27.44 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1094  16S rRNA processing protein RimM  26.79 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000169759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0847  16S rRNA processing protein RimM  27.1 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1375  16S rRNA-processing protein RimM  24.56 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4889  16S rRNA-processing protein RimM  24.03 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1474  16S rRNA processing protein RimM  26.61 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1283  16S rRNA-processing protein RimM  26.61 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.896512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0124  putative 16S rRNA processing protein RimM  24.07 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15980  16S rRNA-processing protein RimM  24.56 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00452583  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2999  16S rRNA processing protein RimM  24.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3041  16S rRNA processing protein RimM  24.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000787897  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1523  16S rRNA processing protein RimM  24.34 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000298148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2859  16S rRNA-processing protein RimM  29.93 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  25.75 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0428  16S rRNA processing protein RimM  24.84 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0085  16S rRNA-processing protein RimM  30.77 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1064  16S rRNA-processing protein RimM  26.09 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000154206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2889  16S rRNA-processing protein RimM  26.38 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0200188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2891  16S rRNA-processing protein RimM  26.38 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.217231  normal  0.505241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2870  16S rRNA-processing protein RimM  26.38 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.71493  normal  0.0226168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2820  16S rRNA-processing protein RimM  26.38 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0156642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3003  16S rRNA-processing protein RimM  26.38 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1491  16S rRNA processing protein RimM  24.36 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0992  16S rRNA-processing protein RimM  28.48 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584349  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02497  16S rRNA-processing protein  26.53 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0146885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1066  16S rRNA processing protein RimM  26.53 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000147404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2767  16S rRNA-processing protein RimM  26.53 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2892  16S rRNA-processing protein RimM  26.53 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1075  16S rRNA-processing protein RimM  26.53 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024634  normal  0.0162863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2760  16S rRNA-processing protein RimM  26.53 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0552999  normal  0.0361654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3847  16S rRNA-processing protein RimM  26.53 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00015023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02461  hypothetical protein  26.53 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00779193  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0848  16S rRNA processing protein RimM  25.62 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2051  16S rRNA processing protein RimM  24.39 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  28.99 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  28.08 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2307  16S rRNA processing protein RimM  22.56 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00013128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2997  16S rRNA-processing protein RimM  25.85 
 
 		 182 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00151494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  26.06 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0967  16S rRNA processing protein RimM  22.89 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000740944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1406  16S rRNA processing protein RimM  26.88 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502149  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0593  hypothetical protein  26.28 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  24.7 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2259  16S rRNA processing protein RimM  27.27 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  27.78 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3400  16S rRNA-processing protein RimM  26.02 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.80773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  24.54 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3429  16S rRNA processing protein RimM  25.17 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000572848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3758  16S rRNA processing protein RimM  24.68 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0504856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1125  16S rRNA-processing protein RimM  26.95 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0465  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0441  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  25.64 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  25.64 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3227  16S rRNA-processing protein RimM  23.81 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.155768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  24.38 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  28.44 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0881  16S rRNA-processing protein RimM  24.49 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.239463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3363  16S rRNA-processing protein RimM  24.49 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0312668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1160  16S rRNA-processing protein RimM  25.47 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0853  16S rRNA-processing protein RimM  26.53 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000199239  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3202  16S rRNA-processing protein RimM  25.45 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0025103  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0812  16S rRNA processing protein RimM  22.73 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.335804  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  25 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2782  16S rRNA processing protein RimM  20.83 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1355  16S rRNA-processing protein RimM  20.48 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000868178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2018  16S rRNA processing protein RimM  20.75 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0112237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2321  16S rRNA processing protein RimM  20.75 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0096  16S rRNA-processing protein RimM  28.3 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000752452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1255  16S rRNA-processing protein RimM  24.84 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000136012  hitchhiker  0.0000512506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  28.23 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1020  16S rRNA-processing protein RimM  25.2 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104306  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  26.24 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1169  16S rRNA-processing protein RimM  25.47 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  28.23 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1294  16S rRNA processing protein RimM  24.22 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1050  16S rRNA-processing protein RimM  25.5 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  25.81 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39550  16S rRNA-processing protein RimM  27.61 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1029  16S rRNA processing protein RimM  18.56 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.635977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  24 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  22.22 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3761  16S rRNA processing protein RimM  22.73 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000217474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4156  16S rRNA-processing protein RimM  29.03 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12723  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  27.46 
 
 		 169 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2837  16S rRNA-processing protein RimM  24.3 
 
 		 176 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2919  16S rRNA-processing protein RimM  24.3 
 
 		 176 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000363709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0885  16S rRNA processing protein RimM  23.73 
 
 		 170 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  22.84 
 
 		 169 aa  42  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0735  16S rRNA processing protein RimM  21.43 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.335769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  26.06 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  24.85 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>