More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_41840  LysR family regulatory protein  100 
 
 		 311 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4173  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3324  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4193  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831327  normal  0.593913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2212  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1830  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0510  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 287 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0948  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4560  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4180  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4891  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 285 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0719515  hitchhiker  0.000498702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3222  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3751  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657019  normal  0.20041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0874  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2572  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2436  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0620  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0291  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0323  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1668  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1471  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5440  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2242  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478296  normal  0.0538104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4400  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0446216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4894  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3621  regulatory protein LysR  29.93 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2854  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 283 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4510  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0990814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3673  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3854  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3912  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0085  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0587  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0390525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3582  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  26.76 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0160  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3983  transcriptional regulator, LysR family  25.22 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  28.41 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  28.41 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  26.79 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4190  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  25.16 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  25.16 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2517  transcriptional regulator, LysR family  25.33 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  25.39 
 
 		 285 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  26.95 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0984  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.95626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2019  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  25 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3882  LysR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0991  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  25.53 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2662  LysR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1269  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0299945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0607  transcriptional regulator, LysR family  25.97 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4068  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  23.64 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  26.09 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>