More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0085 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0085  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  589  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2212  transcriptional regulator, LysR family  48.39 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1830  LysR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3324  LysR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 285 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4173  LysR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 285 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4193  LysR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 285 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831327  normal  0.593913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0510  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0948  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4560  LysR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4180  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2854  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5440  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4894  LysR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4400  LysR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0446216 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4891  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0719515  hitchhiker  0.000498702 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0874  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2572  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3751  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657019  normal  0.20041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3222  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0291  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0323  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0620  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1668  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1471  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2242  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478296  normal  0.0538104 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2436  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4510  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0990814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3673  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3854  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0587  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0390525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3582  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3912  transcriptional regulator, LysR family  35.8 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3621  regulatory protein LysR  35.41 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41840  LysR family regulatory protein  29.43 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0656  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3353  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5014  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1491  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  30.83 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  30.83 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5273  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3628  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4427  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  30 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4760  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 315 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2022  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  28.88 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2043  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0201239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05533  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.42 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  29.3 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4131  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  29.73 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0678  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  0.525189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2469  HTH-type transcriptional regulator PecT  27.45 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000182505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2676  HTH-type transcriptional regulator PecT  27.45 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.784227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2514  HTH-type transcriptional regulator PecT  27.45 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00051335  normal  0.704874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2569  HTH-type transcriptional regulator PecT  27.45 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00146874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4127  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2558  HTH-type transcriptional regulator PecT  27.45 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000175067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>