More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2882 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  39.44 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  36.7 
 
 		 332 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 292 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  39.44 
 
 		 287 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4827  transcriptional regulator, LysR family  39.5 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  36.33 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  39.27 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  37.22 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  36.67 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  36.04 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26470  LysR family transcriptional regulator protein  37.86 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  36.33 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  35.46 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.71 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0800  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  36.22 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0996  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.42 
 
 		 291 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1961  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1157  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1003  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0953  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0276  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000191888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0872  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1608  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  34.1 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1020  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2402  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114186  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5814  LysR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2531  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0368  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1871  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2482  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2507  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>