More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5273 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5273  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3353  LysR family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4427  LysR family transcriptional regulator  98.59 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315882 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5014  LysR family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0656  LysR family transcriptional regulator  96.11 
 
 		 284 aa  553  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3628  LysR family transcriptional regulator  96.82 
 
 		 283 aa  554  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4127  putative transcriptional regulator  38.19 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3678  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47880  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000178644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1800  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.06 
 
 		 284 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  32.16 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  33.81 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  32.87 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0243  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.2 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1020  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  31.93 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1491  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6042  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.957083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  32.74 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.87 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2647  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1269  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0299945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  29.89 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  29.89 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3972  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3983  transcriptional regulator, LysR family  27.88 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5053  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426603  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  34.07 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1890  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0538  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0006  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0014  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0006  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4068  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>