More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1269 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1269  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0299945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4068  LysR family transcriptional regulator  85.22 
 
 		 292 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3793  LysR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 291 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4575  LysR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 291 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5730  LysR family transcriptional regulator  86.11 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  55.48 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  55.12 
 
 		 294 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6042  LysR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 302 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.957083 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5812  LysR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1230  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.71 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2777  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0538  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1890  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 283 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 283 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0673  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123933  decreased coverage  0.00380612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  35.94 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0006  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0006  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0014  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  33.6 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  34.8 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4131  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  31.03 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0277  hypothetical protein  32.67 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  34.06 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  31.88 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3972  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2043  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0201239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4138  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5053  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426603  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0243  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2656  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0274  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>