More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4760 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4760  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  590  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  35.46 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  35.46 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  36.3 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0323  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  36.65 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5843  LysR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.88 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 294 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  38.77 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  35.41 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  39.13 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  33.59 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2742  putative transcriptional regulator  35.69 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  35.6 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.71 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>