More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0345 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0345  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0358305  normal  0.16138 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0402  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.68 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000167602  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  27.54 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.3 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  34.12 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  28.9 
 
 		 707 aa  63.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.91 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  34.15 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1663  DNA polymerase III, epsilon subunit or related 3'-5' exonuclease  27.12 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  32.91 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  31.25 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.91 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  29.19 
 
 		 485 aa  61.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.69 
 
 		 956 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.65 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  30.63 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.66 
 
 		 721 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  28 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.07 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  32.28 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  29.48 
 
 		 1367 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  29.81 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.75 
 
 		 921 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  29.48 
 
 		 1367 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  31.06 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  27.62 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  28.24 
 
 		 729 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 695 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  28.17 
 
 		 1435 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.68 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.61 
 
 		 383 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  26 
 
 		 769 aa  58.2  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  25.88 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.19 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  29.11 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.65 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.04 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  28.99 
 
 		 1426 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.25 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.96 
 
 		 719 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.37 
 
 		 921 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.75 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.9 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.72 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  28.75 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  33.87 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1432  exonuclease  26.06 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  30.36 
 
 		 695 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.65 
 
 		 909 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.27 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.27 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  29.14 
 
 		 616 aa  55.1  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.98 
 
 		 395 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  26.09 
 
 		 1433 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.76 
 
 		 695 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.56 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2148  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.75 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.12 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.3 
 
 		 929 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 921 aa  54.7  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.65 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.45 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.39 
 
 		 960 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.22 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.22 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.72 
 
 		 944 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.69 
 
 		 375 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.52 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.69 
 
 		 375 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.05 
 
 		 398 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.31 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2256  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.01 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  25.14 
 
 		 1447 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  24.54 
 
 		 299 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.82 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.29 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.29 
 
 		 456 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.93 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  27.03 
 
 		 720 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.32 
 
 		 282 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  24.83 
 
 		 315 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.45 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.06 
 
 		 392 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  29.32 
 
 		 1444 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  24.64 
 
 		 970 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  26.86 
 
 		 457 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.71 
 
 		 479 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.95 
 
 		 336 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  24.83 
 
 		 315 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  29.56 
 
 		 379 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2183  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.95 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  25.93 
 
 		 1433 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  25.93 
 
 		 1433 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  25.93 
 
 		 1433 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  25.93 
 
 		 1433 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.47 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  25.93 
 
 		 1433 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.4 
 
 		 481 aa  51.6  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  25.93 
 
 		 1433 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>