101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1965 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  484  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  97.65 
 
 
255 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  60.78 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  49.21 
 
 
294 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  51.64 
 
 
268 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  47.71 
 
 
249 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  46 
 
 
273 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  44.29 
 
 
228 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  32.49 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  39.51 
 
 
273 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  38.92 
 
 
235 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  39.46 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  37.14 
 
 
279 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  41.71 
 
 
262 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  39.7 
 
 
238 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  40.96 
 
 
264 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  37.63 
 
 
237 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  41.21 
 
 
240 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  36.19 
 
 
279 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  40.69 
 
 
235 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  40.96 
 
 
278 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  35.45 
 
 
235 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  33.49 
 
 
251 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  34.92 
 
 
250 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  40.69 
 
 
235 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  41.18 
 
 
235 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  40.69 
 
 
235 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  41.18 
 
 
235 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  45.97 
 
 
282 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  36.09 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  35.2 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  40.18 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  37.5 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  40.54 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  39.38 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  35.9 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  35.86 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  40.2 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  38 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  39.34 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  38.58 
 
 
207 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  41.75 
 
 
204 aa  88.6  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  40.49 
 
 
272 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  37.44 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  36.9 
 
 
206 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  39.13 
 
 
205 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  35.57 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  38.81 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  39.29 
 
 
205 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  39.56 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  37.56 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  41.29 
 
 
236 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  41.29 
 
 
236 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  41.29 
 
 
236 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  41.29 
 
 
236 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  41.29 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  41.29 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  38.27 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  37.23 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  38.73 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  38.73 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  38.27 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  41.29 
 
 
920 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  37.24 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  28.64 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  38.27 
 
 
206 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  29.67 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  39.18 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  28.65 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  29.53 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  28.19 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  25.24 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  29.73 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  29.94 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  31.25 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  30.46 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  30.72 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  29.33 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  28.89 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  26.72 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  28.67 
 
 
169 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  26.77 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  24.62 
 
 
182 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  30.72 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  26.47 
 
 
170 aa  45.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  27.96 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  28 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  28 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  28 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  29.79 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  28 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  30.92 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  31.03 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  31.03 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  26.81 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  28.28 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  31.03 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  28.77 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>