126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003016 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  86.52 
 
 		 230 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  40.19 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  34.01 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  34.36 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  33.85 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  32.95 
 
 		 251 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  35.8 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  32.39 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  35.75 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  35.71 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  31.82 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  35.23 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  31.08 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  29.06 
 
 		 276 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  32.73 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  29.86 
 
 		 290 aa  88.6  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  30.19 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  32.29 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  33.85 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  32.81 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  32.29 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  36.14 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  33.88 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  31.63 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  32.97 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  32.64 
 
 		 206 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  32.81 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  27.11 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  31.14 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  33.52 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  33.52 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  34.13 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  32.78 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  33.14 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  32.97 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  34.07 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  34.07 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  33.82 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  34.07 
 
 		 920 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  31.74 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  33.82 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  33.82 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  33.82 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  29.89 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  34.23 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  34.5 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  34.56 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  25.65 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  36.43 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  28.99 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  29.57 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  28.65 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  28.65 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  24.27 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  34.3 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  30.11 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  24.48 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  28.93 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  28.79 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  28.04 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  29.81 
 
 		 347 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  29.81 
 
 		 347 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  32.02 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  28.89 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  32.86 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  30.1 
 
 		 353 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  23.36 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  28.43 
 
 		 414 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  28.12 
 
 		 349 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  28.89 
 
 		 170 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  30.39 
 
 		 346 aa  45.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  25.51 
 
 		 170 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  25.51 
 
 		 170 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  25.51 
 
 		 170 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  29.17 
 
 		 365 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3617  recA protein  32.35 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  27.93 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  26 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  31.07 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  26 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  27.5 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  32.35 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  28.38 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  27.68 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  29.41 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  27.45 
 
 		 327 aa  43.9  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  28.38 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  29.41 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  27.68 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  32.76 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>