138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02866 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  86.52 
 
 		 230 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  40.18 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  34.52 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  37.42 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  36.81 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  33.14 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  33.65 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  32.97 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  35.05 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  30.73 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  39.39 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  39.39 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  39.76 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  37.99 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  39.39 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  31.42 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  35.38 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  35 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  34.48 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  37.58 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  37.58 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  34.9 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  37.58 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  30.81 
 
 		 290 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  34.64 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  34.64 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  29.05 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  35.15 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  27.82 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  36.03 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  28.93 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  36.3 
 
 		 920 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  36.03 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  36.03 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  36.3 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  36.3 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  36.03 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  36.09 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  34.29 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  37.18 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  30.54 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  31.94 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  30.73 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  32.47 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  32.99 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  34.13 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  29.89 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  29.74 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  30.37 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  32.26 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  34.56 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  29.22 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  31.93 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  35.6 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  32.66 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  37.14 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  31.66 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  29.73 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  30.65 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  29.73 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  25.26 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  28.72 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  26.52 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  32.69 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  32.04 
 
 		 353 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  29.13 
 
 		 347 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  29.13 
 
 		 347 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  29.41 
 
 		 414 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  30.89 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  27.78 
 
 		 170 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  27.62 
 
 		 389 aa  45.4  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  30.69 
 
 		 431 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  31.91 
 
 		 365 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  27 
 
 		 170 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  31.91 
 
 		 365 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  31.91 
 
 		 365 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  33.98 
 
 		 349 aa  45.1  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  28.12 
 
 		 349 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  29.41 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  31.07 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  30.39 
 
 		 374 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3617  recA protein  33.33 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  32.04 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  32.04 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  32.04 
 
 		 362 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  33.33 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  27.03 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  31.07 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  27.03 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  27.5 
 
 		 379 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  30.21 
 
 		 365 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  22.02 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  25.71 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  31.91 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>