93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1936 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  73.37 
 
 		 205 aa  288  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  72.77 
 
 		 223 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  70.15 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  69.65 
 
 		 207 aa  273  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  78.74 
 
 		 183 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  69 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  69.54 
 
 		 206 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  67.16 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  67.16 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  60.29 
 
 		 204 aa  226  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  58.76 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  51.55 
 
 		 290 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  44.56 
 
 		 278 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  47.8 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  46.45 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  47.45 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  46.94 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  45.79 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  49.72 
 
 		 236 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  46.94 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  46.94 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  46.94 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  48.5 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  46.43 
 
 		 235 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  38.22 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  51.83 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  45.11 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  45.11 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  47.78 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  40.66 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  45.13 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  50.61 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  45.99 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  36.5 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  40.43 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  45.51 
 
 		 279 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  44.92 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  44.91 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  47.22 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  47.22 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  47.22 
 
 		 236 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  47.22 
 
 		 236 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  47.22 
 
 		 236 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  47.22 
 
 		 236 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  35.87 
 
 		 276 aa  101  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  38.74 
 
 		 273 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  35.75 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  42.31 
 
 		 309 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  48.78 
 
 		 272 aa  99  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  44.27 
 
 		 342 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  47.06 
 
 		 920 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  46.67 
 
 		 318 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  45.68 
 
 		 249 aa  97.8  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  40.91 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  44.09 
 
 		 262 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  37.31 
 
 		 264 aa  92  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  34.9 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  39.46 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  34 
 
 		 229 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  39.04 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  39.67 
 
 		 255 aa  85.5  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  40.8 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  39.13 
 
 		 255 aa  85.1  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  33.97 
 
 		 300 aa  81.6  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  36.51 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  33.71 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  45.69 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  43.48 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  35.25 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  31.18 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  39.6 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  33.85 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  35.14 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  33.07 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  32.82 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  31.69 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  33.57 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  33.57 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  32.86 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  34.84 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  32.76 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  40.62 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  41.6  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  32.09 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  35 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>