107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0126 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  347  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  65.29 
 
 		 170 aa  222  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  72.3 
 
 		 168 aa  218  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  58.79 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  66.67 
 
 		 170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  62.07 
 
 		 170 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  62.07 
 
 		 170 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  62.07 
 
 		 170 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  62.07 
 
 		 170 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  58.96 
 
 		 170 aa  204  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  58.38 
 
 		 170 aa  201  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  57.8 
 
 		 170 aa  200  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  58.38 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  58.38 
 
 		 170 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  57.99 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  60.36 
 
 		 168 aa  196  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  43.38 
 
 		 290 aa  95.5  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  34.42 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  34.42 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  38.28 
 
 		 278 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  34.48 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  36.51 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  39.67 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  36.84 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  36.52 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  31.88 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  39.81 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  31.37 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  34.92 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  39.81 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  39.81 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  39.81 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  38.67 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  31.2 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  25.81 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  33.91 
 
 		 238 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  28.95 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  34.78 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  30.48 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  30.1 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  32.17 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  29.45 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  30.34 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  31.58 
 
 		 920 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  29.29 
 
 		 300 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  34.69 
 
 		 238 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  27.37 
 
 		 250 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  31.53 
 
 		 249 aa  50.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  29.13 
 
 		 251 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  32.89 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  29.67 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  29.67 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  29.67 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  30.59 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2548  SOS cell division inhibitor  27.19 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  28.67 
 
 		 255 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  26.05 
 
 		 237 aa  47.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  34.69 
 
 		 238 aa  47.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  34.29 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  31.08 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  25.55 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  30.77 
 
 		 244 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  28.89 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  28.67 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2697  SOS cell division inhibitor  28.41 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000388147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  27.66 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  30 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  31.3 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  30.08 
 
 		 262 aa  44.3  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  32.97 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  26.67 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  29.03 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  25.35 
 
 		 318 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  31.78 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  26.09 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  32.97 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  27.91 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  31.33 
 
 		 158 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  33.77 
 
 		 158 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  35.21 
 
 		 253 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  29.29 
 
 		 250 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  35.48 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>