94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0617 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  64.44 
 
 
280 aa  304  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  58.23 
 
 
273 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  52.43 
 
 
264 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  47.81 
 
 
250 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  41.53 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  43.93 
 
 
249 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  42.7 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  36.41 
 
 
235 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  38.5 
 
 
273 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  38.38 
 
 
238 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  38.46 
 
 
278 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  37.3 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  42.86 
 
 
342 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  35.71 
 
 
235 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  36.8 
 
 
279 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  34.97 
 
 
235 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  33.94 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  40.33 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  33.94 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  41.71 
 
 
318 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  33.48 
 
 
235 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  37.63 
 
 
255 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  41.62 
 
 
272 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  33.48 
 
 
235 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  33.94 
 
 
235 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  39.02 
 
 
279 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  33.85 
 
 
236 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  33.52 
 
 
260 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  30.92 
 
 
251 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  38.27 
 
 
206 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  36.56 
 
 
255 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  37.57 
 
 
228 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  38.55 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  37.84 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  35.6 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  37.85 
 
 
290 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  30.39 
 
 
230 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  35.58 
 
 
207 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  37.02 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  41.41 
 
 
309 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  43.1 
 
 
286 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  40.32 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  38.96 
 
 
183 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  38.1 
 
 
205 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  38.04 
 
 
206 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  37.65 
 
 
223 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  35.83 
 
 
262 aa  91.7  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  34.05 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  39.46 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  36.81 
 
 
206 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  36.81 
 
 
206 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  36.81 
 
 
206 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  29.59 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  37.76 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  35.16 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  35.16 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  35.16 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  35.16 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  34.55 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  34.55 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  34.6 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  35.16 
 
 
920 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  30.89 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  30.39 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  30.37 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  32.97 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  30.17 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  36.57 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4903  hypothetical protein  48.1 
 
 
83 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183124 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  30.91 
 
 
214 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  30.91 
 
 
214 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  28.19 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  30.22 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  28.3 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  29.35 
 
 
170 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  26.05 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  28.26 
 
 
170 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  29.87 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  25.86 
 
 
170 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  25.86 
 
 
170 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  26.32 
 
 
168 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  25.23 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  27.21 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  25.66 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  24.14 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  24.14 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  24.14 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  23.08 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  27.27 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  27.27 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  27.27 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  20.42 
 
 
244 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>