98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2740 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  94.66 
 
 		 206 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  94.66 
 
 		 206 aa  360  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  90.29 
 
 		 206 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  71.92 
 
 		 206 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  72.41 
 
 		 207 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  70.15 
 
 		 205 aa  255  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  69.95 
 
 		 205 aa  241  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  63.82 
 
 		 223 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  61.5 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  68.86 
 
 		 183 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  60.31 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  47.94 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  51.58 
 
 		 290 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  46.56 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  50.56 
 
 		 272 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  38.86 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  38.07 
 
 		 240 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  43.96 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  47.25 
 
 		 235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  43.11 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  47.25 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  46.15 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  46.15 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  45.93 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  45.86 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  46.15 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  46.15 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  47.56 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  47.56 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  42 
 
 		 268 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  38.04 
 
 		 276 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  38.5 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  41.33 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  43.08 
 
 		 291 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  40.59 
 
 		 235 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  37.2 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  43.22 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  47.26 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  43.22 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  48.8 
 
 		 238 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  48.97 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  38.04 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  35.68 
 
 		 273 aa  97.8  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  45.06 
 
 		 342 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  36.99 
 
 		 273 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  34.9 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  42.42 
 
 		 279 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  43.24 
 
 		 262 aa  95.5  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  41.76 
 
 		 309 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  44.32 
 
 		 272 aa  94.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  41.89 
 
 		 264 aa  94.7  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  43.35 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  41.82 
 
 		 279 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  45.7 
 
 		 318 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  36.59 
 
 		 280 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  38.78 
 
 		 255 aa  91.3  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  43.59 
 
 		 920 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  47.21 
 
 		 282 aa  91.3  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  38.27 
 
 		 255 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  33.51 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  42.99 
 
 		 286 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  34.18 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  32.12 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  31.86 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  36.51 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  38.21 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  33.89 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  36.44 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  31.76 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  36.13 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  33.63 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  33.03 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  35.19 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  34.04 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  31.29 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  32.26 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  33.94 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  35.95 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  30.98 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  26.52 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  25.97 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  30.12 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  31.03 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  34.25 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>