87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1534 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  100 
 
 
262 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  42.06 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  46.53 
 
 
236 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  43.65 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  46.04 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  45.54 
 
 
235 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  45.05 
 
 
235 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  45.54 
 
 
228 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  45.05 
 
 
235 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  45.05 
 
 
235 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  44.55 
 
 
235 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  39.59 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  37.88 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  44.55 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  49.78 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  46.46 
 
 
238 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  39.91 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  43.72 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  41.71 
 
 
255 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  35.22 
 
 
279 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  41.71 
 
 
255 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  36.13 
 
 
279 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  42.92 
 
 
204 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  44.55 
 
 
238 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  30.09 
 
 
240 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  42.27 
 
 
238 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  41.59 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  33.65 
 
 
230 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  44.22 
 
 
920 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  42.86 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  43.27 
 
 
290 aa  95.1  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  37.62 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  36.73 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  37.62 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  44.09 
 
 
205 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  44.22 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  44.22 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  44.22 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  44.22 
 
 
236 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  44.22 
 
 
236 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  44.22 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  31.84 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  35.83 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  37.05 
 
 
240 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  40.54 
 
 
206 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  30.14 
 
 
230 aa  89.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  42.38 
 
 
309 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  40.2 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  44.86 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  34.78 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  44.86 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  42.45 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  35.8 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  37.84 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  40.83 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  39.26 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  40.83 
 
 
205 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  31.51 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  42.14 
 
 
183 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  42.16 
 
 
206 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  38.27 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  33.51 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  39.39 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  41.95 
 
 
206 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  33.04 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  36.14 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  41.13 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  41.36 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  29.32 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  39.04 
 
 
207 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  32.45 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  30.05 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  34.32 
 
 
318 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  33.14 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  35.57 
 
 
207 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  36.63 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  30.08 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  32.75 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  30.59 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  28.74 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2338  hypothetical protein  37.35 
 
 
228 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1610  hypothetical protein  35.48 
 
 
226 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  28.32 
 
 
343 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  33.98 
 
 
156 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  24.4 
 
 
347 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>