79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5399 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  516  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  55.56 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  52.34 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  50.65 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  35.65 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  37.44 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  37.44 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  33.04 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  37.19 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  32.74 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  33.02 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  31.63 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  35.38 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  33.85 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  33.5 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  33.68 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  32.37 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  30.85 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  31.78 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  35.26 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  29.02 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  32.11 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  33.78 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  29.06 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  32.64 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  28.06 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  33.77 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  33.48 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  32.13 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  34.62 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  29.82 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  30.36 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  27.8 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  29.75 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  27.03 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  27.81 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  25.9 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  35.96 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  32.8 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  30.67 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  29.63 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  28.71 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  26.12 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  32.14 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  28.23 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  27.5 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  25.18 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  29.33 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  28.35 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  36.59 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  30.5 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  26.72 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  27.34 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  25.9 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  25.18 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  24.82 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  25.36 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  22.44 
 
 		 183 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  25.19 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  31.11 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  30.38 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  27.59 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  30.38 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  22.7 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  28.03 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  27.97 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  24.09 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  26.35 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  26.52 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  23.36 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  28.74 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  24.46 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  23.36 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  23.36 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  24.46 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  23.91 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  25.76 
 
 		 207 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>